RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 ARL3P36405 182 aa10.56□□□□□ -0.72
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UBASH3B-202ENST00000525711 SLC25A24Q6NUK1 477 aa10.56□□□□□ -0.72
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UBASH3B-202ENST00000525711 C5orf51A6NDU8 294 aa10.54□□□□□ -0.72
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UBASH3B-202ENST00000525711 SSNA1O43805 119 aa10.53□□□□□ -0.72
UBASH3B-202ENST00000525711 NXPH3O95157 252 aa10.53□□□□□ -0.72
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UBASH3B-202ENST00000525711 MFFQ9GZY8 342 aa10.53□□□□□ -0.72
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UBASH3B-202ENST00000525711 K7EIM0 57 aa10.52□□□□□ -0.73
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UBASH3B-202ENST00000525711 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
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UBASH3B-202ENST00000525711 NMES1Q9C002 83 aa10.52□□□□□ -0.73
UBASH3B-202ENST00000525711 MAGT1Q9H0U3 335 aa10.52□□□□□ -0.73
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UBASH3B-202ENST00000525711 MUC4Q99102 2169 aa10.52□□□□□ -0.73
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UBASH3B-202ENST00000525711 IFNA10P01566 189 aa10.51□□□□□ -0.73
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UBASH3B-202ENST00000525711 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP10.51□□□□□ -0.73
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UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM170AQ8WVE7 144 aa10.51□□□□□ -0.73
UBASH3B-202ENST00000525711 TXN2Q99757 166 aa10.51□□□□□ -0.73
UBASH3B-202ENST00000525711 UBQLN2Q9UHD9 624 aa10.51□□□□□ -0.73
UBASH3B-202ENST00000525711 MFSD2BA6NFX1 497 aa10.5□□□□□ -0.73
UBASH3B-202ENST00000525711 MT-CO2P00403 227 aa10.5□□□□□ -0.73
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UBASH3B-202ENST00000525711 C8orf88P0DMB2 117 aa10.5□□□□□ -0.73
UBASH3B-202ENST00000525711 ELLP55199 621 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
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UBASH3B-202ENST00000525711 H2BFSP57053 126 aa10.5□□□□□ -0.73
UBASH3B-202ENST00000525711 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa10.5□□□□□ -0.73
UBASH3B-202ENST00000525711 LINC00336Q6ZUF6 198 aa10.5□□□□□ -0.73
UBASH3B-202ENST00000525711 C11orf45Q8TAV5 145 aa10.5□□□□□ -0.73
UBASH3B-202ENST00000525711 C2CD4CQ8TF44 421 aa10.5□□□□□ -0.73
UBASH3B-202ENST00000525711 MISP3Q96FF7 219 aa10.5□□□□□ -0.73
UBASH3B-202ENST00000525711 MED28Q9H204 178 aa10.5□□□□□ -0.73
UBASH3B-202ENST00000525711 C21orf62Q9NYP8 219 aa10.5□□□□□ -0.73
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UBASH3B-202ENST00000525711 S4R3C0 116 aa10.5□□□□□ -0.73
UBASH3B-202ENST00000525711 SIX6O95475 246 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-202ENST00000525711 IAPPP10997 89 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-202ENST00000525711 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-202ENST00000525711 MFAP4P55083 255 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-202ENST00000525711 RAB11AP62491 216 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-202ENST00000525711 ETFRF1Q6IPR1 90 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-202ENST00000525711 PSENENQ9NZ42 101 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-202ENST00000525711 MGAT4CQ9UBM8 478 aa10.49□□□□□ -0.73
UBASH3B-202ENST00000525711 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
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