RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 IGLL1P15814 213 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 WT1-ASQ06250 92 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 PRR27Q6MZM9 219 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 NPIPB3Q92617 1050 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 SMIM12Q96EX1 92 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 KLF12Q9Y4X4 402 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 LINC00312Q9Y6C7 94 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 GNG5P63218 68 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 TEX36Q5VZQ5 186 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 SPATA12Q7Z6I5 190 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 MUC15Q8N387 334 aa9.29□□□□□ -0.92
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PTPRK-217ENST00000524534 EPDR1Q9UM22 224 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 COX11Q9Y6N1 276 aa9.29□□□□□ -0.92
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PTPRK-217ENST00000524534 PTTG1IPP53801 180 aa9.28□□□□□ -0.92
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PTPRK-217ENST00000524534 KIR3DL3Q8N743 410 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 OR4A5Q8NH83 315 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 SP9P0CG40 484 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 FAM120AOSQ5T036 256 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF596Q8TC21 504 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
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PTPRK-217ENST00000524534 ASCL3Q9NQ33 180 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 C1RLQ9NZP8 487 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
PTPRK-217ENST00000524534 COL6A3P12111 3177 aa9.27□□□□□ -0.92
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PTPRK-217ENST00000524534 CA7P43166 264 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 UBE2V1Q13404 147 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 FAM162BQ5T6X4 162 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 LINC00305Q7Z4B0 112 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRK-217ENST00000524534 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 HBBP68871 147 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 C10orf55Q5SWW7 151 aa9.26□□□□□ -0.93
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PTPRK-217ENST00000524534 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
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PTPRK-217ENST00000524534 IGLV2-23P01705 113 aa9.26□□□□□ -0.93
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PTPRK-217ENST00000524534 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 CT83Q5H943 113 aa9.26□□□□□ -0.93
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PTPRK-217ENST00000524534 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 SSX8Q7RTT4 187 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 TCF24Q7RTU0 167 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 OR2D3Q8NGH3 330 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 OR4C13Q8NGP0 309 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 GUCD1Q96NT3 240 aa9.26□□□□□ -0.93
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PTPRK-217ENST00000524534 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 CADP27708 2225 aa9.26□□□□□ -0.93
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PTPRK-217ENST00000524534 PLAUP00749 431 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 TNFSF4P23510 183 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 PERPQ96FX8 193 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 REG1BP48304 166 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 PCP4P48539 62 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 GTSF1Q8WW33 167 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 SGK494Q96LW2 274 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF492Q9P255 531 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 OR4C46A6NHA9 309 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 A8MWL6 223 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 C22orf46C9J442 243 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 K7EP13 123 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 LTAP01374 205 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 CRYGCP07315 174 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRK-217ENST00000524534 CCL3L1P16619 93 aa9.24□□□□□ -0.93
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