RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524095.5

CLVS1-211, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 3

Gene CLVS1, Length 709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-211ENST00000524095 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 DHRS11Q6UWP2 260 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 OR4X1Q8NH49 305 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 RNF141Q8WVD5 230 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 SEC22AQ96IW7 307 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 CLUHP3Q96NS8 147 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 PDCD5O14737 125 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 IGKV1-39P01597 117 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 IGKV1D-39P04432 117 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 RLN1P04808 185 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 AZU1P20160 251 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 ALDH3B2P48448 385 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 ARPC4P59998 168 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 HAMPP81172 84 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 RRN3P1Q2M238 152 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 OR4A16Q8NH70 328 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 LINC00052Q96N35 136 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 NRN1Q9NPD7 142 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 ACOT13Q9NPJ3 140 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF586Q9NXT0 402 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 RNF213Q63HN8 5207 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 A0A1W2PPQ1 181 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 PLAC8L1A1L4L8 177 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 SMIM30A4D0T7 59 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 CBY3A6NI87 242 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 BUB3O43684 328 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 RAB3BP20337 219 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 RFX2P48378 723 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 PSG9Q00887 426 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 DHODHQ02127 395 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 CLINT1Q14677 625 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 ICAM4Q14773 271 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF79Q15937 498 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 TTC32Q5I0X7 151 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 TMEM17Q86X19 198 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 C10orf67Q8IYJ2 551 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 OR4B1Q8NGF8 309 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 TSC22D3Q99576 134 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 MGLLQ99685 303 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 TRAV18A0A075B6X5 111 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 A0A0B4J293 547 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 LYRM9A8MSI8 78 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 F6UB75 175 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 INS-IGF2F8WCM5 200 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 ELK1P19419 428 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 SNCAP37840 140 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 ETV6P41212 452 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 RPL5P46777 297 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 LINC00315P59091 139 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 FAM78BQ5VT40 261 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 FOXI2Q6ZQN5 318 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 Q6ZSN1 163 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 TSPAN14Q8NG11 270 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 OR5AP2Q8NGF4 316 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 Q8WTZ3 238 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 UPK3BQ9BT76 320 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 CCDC90BQ9GZT6 254 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 MAGT1Q9H0U3 335 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 DUSP21Q9H596 190 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 PTTG2Q9NZH5 202 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 KLK11Q9UBX7 282 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 M0QYG6 137 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 SOCS3O14543 225 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 NXPH3O95157 252 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 IFNA5P01569 189 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 ATP5G1P05496 136 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 IGLC1P0CG04 106 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 ATP5G3P48201 142 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 TMEM69Q5SWH9 247 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 CDPF1Q6NVV7 123 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 AMTNQ6UX39 209 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 PACRGLQ8N7B6 248 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 AUNIPQ9H7T9 357 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-211ENST00000524095 A0A087WTM6 91 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-211ENST00000524095 A0A0J9YX75 114 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-211ENST00000524095 MEIS3P1A6NDR6 274 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-211ENST00000524095 NOTOA8MTQ0 251 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-211ENST00000524095 A8MTW9 85 aa5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms