RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 OOEPA6NGQ2 149 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 C9JCJ5 164 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 C12orf77C9JDV5 145 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 FNDC10F2Z333 226 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 M0QZK8 103 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 SIRPB1O00241 398 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 ITGB1BP1O14713 200 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 CDIPTO14735 213 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 RAMP3O60896 148 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 MMP23AO75900 390 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 TNFSF15O95150 251 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 HAND1O96004 215 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 IGHV3-9P01782 118 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 HBZP02008 142 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 STAG3L2P0CL84 134 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 STAG3L3P0CL85 134 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 CCL2P13500 99 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 AREGP15514 252 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 TUBG1P23258 451 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 CD82P27701 267 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 OPRK1P41145 380 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 KIR2DS2P43631 304 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 CYB561P49447 251 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 TNFSF10P50591 281 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 TDGF1P3P51864 188 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 HTD2P86397 168 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 PLGLB1Q02325 96 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 OR1C1Q15619 314 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 TBC1D28Q2M2D7 210 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 OR8G2PQ6IF36 304 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 TRAT1Q6PIZ9 186 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 MDP1Q86V88 176 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 TUSC5Q8IXB3 177 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 TDHQ8IZJ6 230 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 TMEM251Q8N6I4 163 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 ZNF709Q8N972 641 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 NECAP1Q8NC96 275 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 OR4F5Q8NH21 305 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 IL1F10Q8WWZ1 152 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 COQ2Q96H96 371 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 SFRP2Q96HF1 295 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 OR4F4Q96R69 305 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 SFXN3Q9BWM7 321 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 GGTLC1Q9BX51 225 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 TTTY12Q9BZ98 90 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 A0A0C4DFX4 3053 aa3.16□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 CACNA1EQ15878 2313 aa3.15□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 LAMA3Q16787 3333 aa3.15□□□□□ -1.9
SGCE-211ENST00000522045 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 C17orf98A8MV24 154 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 C21orf140B9A014 251 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 C15orf65H3BRN8 121 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 M0R143 59 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 SH2D1BO14796 132 aa3.15□□□□□ -1.91
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SGCE-211ENST00000522045 TRAPPC6AO75865 159 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 TNFSF13O75888 250 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 CXorf1O96002 111 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 MT-ND6P03923 174 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 OR4A8P0C604 315 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 OR10J4P0C629 311 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 CCNOP22674 350 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ACP1P24666 158 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 OR10J1P30954 320 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 OTX2P32243 289 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 G6PCP35575 357 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 OR3A1P47881 315 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ATP5G3P48201 142 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 RANP62826 216 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 PAFAH1B2P68402 229 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 TGFBR3Q03167 851 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 Q0VG73 95 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 GUSBP1Q15486 140 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 COX19Q49B96 90 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 DCAF12Q5T6F0 453 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 FAM78BQ5VT40 261 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 C9orf135Q5VTT2 229 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 FBXW9Q5XUX1 488 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 IGFL2Q6UWQ7 119 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 MDS2Q8NDY4 140 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 OR1L1Q8NH94 360 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 LINC01006Q8NI28 216 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 CMTM2Q8TAZ6 248 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 GALMQ96C23 342 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 MGST2Q99735 147 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 PAXXQ9BUH6 204 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 OR51B6Q9H340 312 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 TUBG2Q9NRH3 451 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 TMEM106BQ9NUM4 274 aa3.15□□□□□ -1.91
SGCE-211ENST00000522045 FKBP11Q9NYL4 201 aa3.15□□□□□ -1.91
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