RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	LFNG	Q8NES3	379 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR5T1	Q8NG75	326 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	ASB13	Q8WXK3	278 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	DCUN1D4	Q92564	292 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARPC1A	Q92747	370 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	AQP10	Q96PS8	301 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	PARP11	Q9NR21	331 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZFHX3	Q15911	3703 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266		E5RGE8	158 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLDN34	H7C241	214 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266		I3L2K1	104 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266		K7EIM0	57 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSC22D2	O75157	780 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGF1	P05019	195 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLGLA	Q15195	96 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMUB2	Q71RG4	321 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM86B	Q8N661	226 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	NRAC	Q8N912	160 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR5R1	Q8NH85	324 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB40C	Q96S21	281 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	MFF	Q9GZY8	342 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBXL17	Q9UF56	701 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSPB11	Q9Y547	144 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266		S4R3C0	116 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATR	Q13535	2644 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSPAN9	O75954	239 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	CNIH1	O95406	144 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	TOMM40	O96008	361 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	NPY1R	P25929	384 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAV2	P51636	162 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	OPCML	Q14982	345 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	ECSCR	Q19T08	205 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	STPG2	Q8N412	459 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARV1	Q9H2C2	271 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PN81	502 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266		L7N2F9	121 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAGE4	O60829	102 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	MED6	O75586	246 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFNA10	P01566	189 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	HNF1A	P20823	631 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHRNA7	P36544	502 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	SULT1A1	P50225	295 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	FGL1	Q08830	312 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	GAMT	Q14353	236 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLINT1	Q14677	625 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR1P1	Q8NH06	330 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	MS4A10	Q96PG2	267 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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