RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-206ENST00000487539 RAB9BQ9NP90 201 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 CLN6Q9NWW5 311 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 SDHAF2Q9NX18 166 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 TAS2R4Q9NYW5 299 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 TVP23BQ9NYZ1 205 aa2.76□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 SSPOA2VEC9 5147 aa2.75□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa2.75□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 OR4C45A6NMZ5 311 aa2.75□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 ITGB1BP1O14713 200 aa2.75□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 NPPAP01160 153 aa2.75□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 IGHV3-48P01763 117 aa2.75□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 DEFA4P12838 97 aa2.75□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 GNRHRP30968 328 aa2.75□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 PSMD7P51665 324 aa2.75□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 ACTR3P61158 418 aa2.75□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 CDK10Q15131 360 aa2.75□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 GLT8D1Q68CQ7 371 aa2.75□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 OR10K2Q6IF99 312 aa2.75□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 HS3ST5Q8IZT8 346 aa2.75□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 ZNF709Q8N972 641 aa2.75□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 DUSP18Q8NEJ0 188 aa2.75□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 OR10W1Q8NGF6 305 aa2.75□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 RXFP4Q8TDU9 374 aa2.75□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 FAAP24Q9BTP7 215 aa2.75□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 GID8Q9NWU2 228 aa2.75□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 IL36GQ9NZH8 169 aa2.75□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 GNG8Q9UK08 70 aa2.75□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 A0A096LPF7 62 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 TRAV2A0A0B4J234 112 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 TRAV3A0A0B4J244 114 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 TRAV34A0A0B4J273 112 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 IGLC7A0M8Q6 106 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 K7EIM0 57 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 LECT2O14960 151 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 SOCS1O15524 211 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 DCTN3O75935 186 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 HBE1P02100 147 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 HMGN1P05114 100 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 ATP5G1P05496 136 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 ATP5G3P48201 142 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 ALDH3B2P48448 385 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 RPL30P62888 115 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 Q1RN00 199 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 RRN3P1Q2M238 152 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 COQ5Q5HYK3 327 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 OR2B11Q5JQS5 317 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 AADACL4Q5VUY2 407 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 ZNF880Q6PDB4 577 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 TOMM20LQ6UXN7 152 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 MNS1Q8NEH6 495 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 OR10G2Q8NGC3 310 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 VN1R17PQ8TDU5 208 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 PTX4Q96A99 478 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 VSIG2Q96IQ7 327 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 LINC01600Q96MT4 127 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 SELENOIQ9C0D9 397 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 OR51E2Q9H255 320 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 RDH8Q9NYR8 311 aa2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 V9GYY5 206 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 PANO1I0J062 215 aa2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 CCSO14618 274 aa2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 SULT1C4O75897 302 aa2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 CST1P01037 141 aa2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 GTF2F2P13984 249 aa2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 RAB3AP20336 220 aa2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 ATP6V1B2P21281 511 aa2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 VSNL1P62760 191 aa2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 DHRS2Q13268 280 aa2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 Q56UQ5 140 aa2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 LINC00242Q5T6M2 205 aa2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 SLC25A24Q6NUK1 477 aa2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 C6orf201Q7Z4U5 140 aa2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 TMED4Q7Z7H5 227 aa2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 OR5D14Q8NGL3 314 aa2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 MCUR1Q96AQ8 359 aa2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 THTPAQ9BU02 230 aa2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 OR2D2Q9H210 308 aa2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 SAR1AQ9NR31 198 aa2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 C21orf62Q9NYP8 219 aa2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 ABRACLQ9P1F3 81 aa2.73□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 A0A0G2JND7 137 aa2.72□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 HELTA6NFD8 242 aa2.72□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 LYRM9A8MSI8 78 aa2.72□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 BBIP1A8MTZ0 92 aa2.72□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 F6UB75 175 aa2.72□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 J3QRK9 145 aa2.72□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 DENRO43583 198 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 PDCD6O75340 191 aa2.72□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 CA11O75493 328 aa2.72□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 KBTBD11O94819 623 aa2.72□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 HLA-DRB4P13762 266 aa2.72□□□□□ -1.97
CNN3-206ENST00000487539 ELK1P19419 428 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.6 ms