RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	12.56	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		12.56	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290		H3BP45	60 aa		12.55	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	SCGB1D2	O95969	90 aa		12.55	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	FOLR2	P14207	255 aa		12.55	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB32	Q13637	225 aa		12.55	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	GAMT	Q14353	236 aa		12.55	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	THAP8	Q8NA92	274 aa		12.55	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	12.55	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		12.54	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	CBLN1	P23435	193 aa		12.54	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	OR10J1	P30954	320 aa		12.54	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		12.54	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	NPIPB3	Q92617	1050 aa		12.54	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC35E1	Q96K37	410 aa		12.54	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		12.53	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	SSNA1	O43805	119 aa		12.53	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	DEDD	O75618	318 aa		12.53	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	EDN2	P20800	178 aa		12.53	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	DLK1	P80370	383 aa		12.53	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		12.53	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	TM4SF20	Q53R12	229 aa		12.53	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		12.53	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	TRGV9	Q99603	122 aa		12.53	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	GGACT	Q9BVM4	153 aa		12.53	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	12.53	□□□□□ -0.4
HCLS1-208	ENST00000487290	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		12.52	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF320	A2RRD8	509 aa		12.52	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	SIX6	O95475	246 aa		12.52	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	TOMM40	O96008	361 aa		12.52	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	DEFA6	Q01524	100 aa		12.52	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	TIGIT	Q495A1	244 aa		12.52	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		12.52	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	ASB13	Q8WXK3	278 aa		12.52	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		12.52	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	LCN12	Q6JVE5	192 aa		12.51	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		12.51	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	ACY3	Q96HD9	319 aa		12.51	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	GINS3	Q9BRX5	216 aa		12.51	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	VSIR	Q9H7M9	311 aa		12.51	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	MLX	Q9UH92	298 aa		12.51	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290		H0YIZ8	118 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290		L7N2F9	121 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	CCNK	O75909	580 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	CRYBB3	P26998	211 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	S100A10	P60903	97 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	VAMP2	P63027	116 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	SMPX	Q9UHP9	88 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290		U3KQE9	123 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290		K7EIL1	84 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	LYL1	P12980	280 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	GP9	P14770	177 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	CXCL3	P19876	107 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	ARL16	Q0P5N6	197 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	VWC2	Q2TAL6	325 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290		E5RGE8	158 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	CHEK1	O14757	476 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	MPC2	O95563	127 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	FABP1	P07148	127 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	PET100	P0DJ07	73 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	P2RY1	P47900	373 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	SULT1A1	P50225	295 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	BTNL8	Q6UX41	500 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290		Q8WTZ3	238 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	MED28	Q9H204	178 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	IGSF23	A1L1A6	192 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	ZFP92	A6NM28	416 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF785	A8K8V0	405 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	TSPAN4	O14817	238 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	YIF1A	O95070	293 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	RD3L	P0DJH9	198 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	PSG1	P11464	419 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	CAV2	P51636	162 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-208	ENST00000487290	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41

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