RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475302.1

ITGA6-210, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA6, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-210ENST00000475302 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 A0A1B0GV50 99 aa7.57□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 IGHV3-48P01763 117 aa7.57□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 OR5G3P0C626 314 aa7.57□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 IGLC1P0CG04 106 aa7.57□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 RND2P52198 227 aa7.57□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
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ITGA6-210ENST00000475302 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.57□□□□□ -1.2
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ITGA6-210ENST00000475302 ACY3Q96HD9 319 aa7.57□□□□□ -1.2
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ITGA6-210ENST00000475302 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.57□□□□□ -1.2
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ITGA6-210ENST00000475302 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.57□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.25e-6■■■■□ 22.8
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ITGA6-210ENST00000475302 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.54□□□□□ -1.2
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ITGA6-210ENST00000475302 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.54□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.54□□□□□ -1.2
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ITGA6-210ENST00000475302 VAX2Q9UIW0 290 aa7.54□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 NAV2Q8IVL1 2488 aa7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 A0A1W2PPV4 95 aa7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 ZFP92A6NM28 416 aa7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 G3V318 75 aa7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 M0QZK8 103 aa7.53□□□□□ -1.2
ITGA6-210ENST00000475302 CXorf1O96002 111 aa7.53□□□□□ -1.2
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