RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 DLK1P80370 383 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 RHOGP84095 191 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 ETFRF1Q6IPR1 90 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 SLC16A13Q7RTY0 426 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 LILRB2Q8N423 598 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 ZNF491Q8N8L2 437 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 NECAP1Q8NC96 275 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 OR5C1Q8NGR4 320 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 MS4A10Q96PG2 267 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 SMIM3Q9BZL3 60 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 SLA2Q9H6Q3 261 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 FBXL17Q9UF56 701 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 FBXL7Q9UJT9 491 aa9.56□□□□□ -0.88
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PRAME-208ENST00000438888 FAM223BA6NKX1 122 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 I3L2K1 104 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 I3L521 148 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 K7EIM0 57 aa9.55□□□□□ -0.88
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PRAME-208ENST00000438888 SLURP1P55000 103 aa9.55□□□□□ -0.88
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PRAME-208ENST00000438888 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
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PRAME-208ENST00000438888 ATP6V1FQ16864 119 aa9.55□□□□□ -0.88
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PRAME-208ENST00000438888 FAM223AQ8IWN6 122 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 MUC7Q8TAX7 377 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 MYOZ3Q8TDC0 251 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 CACNG8Q8WXS5 425 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 SLC35E1Q96K37 410 aa9.55□□□□□ -0.88
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PRAME-208ENST00000438888 RCHY1Q96PM5 261 aa9.55□□□□□ -0.88
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PRAME-208ENST00000438888 ARL6Q9H0F7 186 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 FNDC10F2Z333 226 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 OVOL1O14753 267 aa9.54□□□□□ -0.88
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PRAME-208ENST00000438888 DFFBO76075 338 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 DEFA5Q01523 94 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 C15orf32Q32M92 178 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 TMUB2Q71RG4 321 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 ATP5SQ99766 215 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.54□□□□□ -0.88
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PRAME-208ENST00000438888 SMCO3A2RU48 225 aa9.53□□□□□ -0.88
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PRAME-208ENST00000438888 IGHV3-48P01763 117 aa9.53□□□□□ -0.88
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PRAME-208ENST00000438888 MLANAQ16655 118 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 VWC2Q2TAL6 325 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 CASC10Q5T4H9 136 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 ACSM6Q6P461 480 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 VN1R17PQ8TDU5 208 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 SCARB1Q8WTV0 552 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 USMG5Q96IX5 58 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 CXorf58Q96LI9 332 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 WFDC1Q9HC57 220 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 TENM2Q9NT68 2774 aa9.52□□□□□ -0.88
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PRAME-208ENST00000438888 A0A087WW49 117 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-208ENST00000438888 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-208ENST00000438888 A0A0G2JLM5 398 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-208ENST00000438888 MFSD2BA6NFX1 497 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-208ENST00000438888 IGHV3-11P01762 117 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-208ENST00000438888 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-208ENST00000438888 RND2P52198 227 aa9.52□□□□□ -0.89
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PRAME-208ENST00000438888 GAMTQ14353 236 aa9.52□□□□□ -0.89
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PRAME-208ENST00000438888 ACY3Q96HD9 319 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-208ENST00000438888 C21orf62Q9NYP8 219 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-208ENST00000438888 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PRAME-208ENST00000438888 S4R3C0 116 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-208ENST00000438888 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-208ENST00000438888 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-208ENST00000438888 LINC01619G3V211 115 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-208ENST00000438888 IFNA5P01569 189 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-208ENST00000438888 GP9P14770 177 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-208ENST00000438888 MFAP4P55083 255 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-208ENST00000438888 OPCMLQ14982 345 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-208ENST00000438888 TMEM144Q7Z5S9 345 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-208ENST00000438888 TMEM116Q8NCL8 245 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-208ENST00000438888 OR4X1Q8NH49 305 aa9.51□□□□□ -0.89
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