RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
PTPRJ-201ENST00000418331 DUX3Q96PT4 197 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRJ-201ENST00000418331 GGTLC1Q9BX51 225 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRJ-201ENST00000418331 OR11H12B2RN74 326 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 OR11H1Q8NG94 326 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 OR11H2Q8NH07 326 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 PGPEP1LA6NFU8 196 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM209BQ5JX69 171 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 COQ2Q96H96 371 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 ORMDL3Q8N138 153 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 OCC1Q8TAD7 63 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 ASCL2Q99929 193 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 OSTCQ9NRP0 149 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 K7ERU9 68 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 ADIPOQQ15848 244 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 MOB4Q9Y3A3 225 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 PEMTQ9UBM1 199 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 PAX1P15863 534 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 SMIM12Q96EX1 92 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1W2PRX2 142 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 PMCHL2Q9BQD1 86 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 PSG8Q9UQ74 426 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 U3KQA8 63 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 WNT2P09544 360 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 TCF23Q7RTU1 214 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 C8orf46Q8TAG6 207 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 GAFA1Q96PS6 74 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 HOXA5P20719 270 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM71F2Q6NXP2 309 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM19A2Q8N3H0 131 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP5LO75964 103 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 MEIG1Q5JSS6 88 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM170BQ5T4T1 132 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAV3A0A0B4J244 114 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAV5A0A0B4J249 113 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 STAG3L3P0CL85 134 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 LINC00527Q9UJ94 153 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 PTPRDP23468 1912 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF407Q9C0G0 2248 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 ASCL4Q6XD76 172 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 PSMB11A5LHX3 300 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 CD5P06127 495 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 Q6ZS49 121 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 VMO1Q7Z5L0 202 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 LINC00473A8K010 186 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 GLMPQ8WWB7 406 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 KLRD1Q13241 179 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM170AQ8WVE7 144 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 SCGB3A1Q96QR1 104 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM169BQ8N8A8 192 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 LINC01587Q99440 93 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 GNLYP22749 145 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 TEX38Q6PEX7 206 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 SERF1AO75920 110 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 TSC2P49815 1807 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 PAX8Q06710 450 aa17.58■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF5Q99942 180 aa17.58■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.41
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAV41A0A0B4J266 112 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRJ-201ENST00000418331 OOSP1A8MZH6 123 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRJ-201ENST00000418331 ABCA1O95477 2261 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRJ-201ENST00000418331 NLRC5Q86WI3 1866 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRJ-201ENST00000418331 ABCA4P78363 2273 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRJ-201ENST00000418331 H0YJW9 148 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRJ-201ENST00000418331 CTAG1AP78358 180 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRJ-201ENST00000418331 MINOS1Q5TGZ0 78 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRJ-201ENST00000418331 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRJ-201ENST00000418331 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRJ-201ENST00000418331 WNK2Q9Y3S1 2297 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM262E9PQX1 116 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRJ-201ENST00000418331 C20orf204Q6ZNR8 217 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRJ-201ENST00000418331 C14orf144Q96I85 54 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRJ-201ENST00000418331 FOXC2Q99958 501 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
PTPRJ-201ENST00000418331 DSCR9P59020 149 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRJ-201ENST00000418331 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRJ-201ENST00000418331 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRJ-201ENST00000418331 COPS9Q8WXC6 57 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRJ-201ENST00000418331 ADMP35318 185 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRJ-201ENST00000418331 PSG1P11464 419 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRJ-201ENST00000418331 LRRK1Q38SD2 2015 aa17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 363.3 ms