RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
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SH3BP5-204ENST00000412806 C10orf113Q5VZT2 155 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP5-204ENST00000412806 TTC9CQ8N5M4 171 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP5-204ENST00000412806 PFDN5Q99471 154 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP5-204ENST00000412806 RNF2Q99496 336 aa17.03■□□□□ 0.32
SH3BP5-204ENST00000412806 SMIM7Q9BQ49 75 aa17.03■□□□□ 0.32
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SH3BP5-204ENST00000412806 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa17.01■□□□□ 0.31
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SH3BP5-204ENST00000412806 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP17.01■□□□□ 0.315e-6■■■■□ 23.8
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SH3BP5-204ENST00000412806 CELSR2Q9HCU4 2923 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM167BQ9NRX6 74 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa17■□□□□ 0.31
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SH3BP5-204ENST00000412806 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
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SH3BP5-204ENST00000412806 TIGITQ495A1 244 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM219Q86XT9 240 aa17■□□□□ 0.31
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SH3BP5-204ENST00000412806 C15orf54Q8N8G6 183 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP5-204ENST00000412806 LINC01356Q8N9X3 169 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP5-204ENST00000412806 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
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SH3BP5-204ENST00000412806 ATP6V0E1O15342 81 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP5-204ENST00000412806 PSG1P11464 419 aa16.98■□□□□ 0.31
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SH3BP5-204ENST00000412806 SGMS2Q8NHU3 365 aa16.98■□□□□ 0.31
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SH3BP5-204ENST00000412806 B4DEV8 164 aa16.97■□□□□ 0.31
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SH3BP5-204ENST00000412806 SSX3Q99909 188 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP5-204ENST00000412806 DERL1Q9BUN8 251 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP5-204ENST00000412806 OR2C1O95371 312 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP5-204ENST00000412806 IGKV1-17P01599 117 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP5-204ENST00000412806 GATA3P23771 443 aa16.96■□□□□ 0.31
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SH3BP5-204ENST00000412806 POLQO75417 2590 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP5-204ENST00000412806 RNF223E7ERA6 249 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP5-204ENST00000412806 HYPMO75409 117 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP5-204ENST00000412806 NDUFB8O95169 186 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP5-204ENST00000412806 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP5-204ENST00000412806 ECSCRQ19T08 205 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP5-204ENST00000412806 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP5-204ENST00000412806 HIST1H2BAQ96A08 127 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP5-204ENST00000412806 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP5-204ENST00000412806 OR2J3O76001 311 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP5-204ENST00000412806 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP5-204ENST00000412806 PAXXQ9BUH6 204 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP5-204ENST00000412806 OR51M1Q9H341 326 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP5-204ENST00000412806 CHD6Q8TD26 2715 aa16.94■□□□□ 0.3
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