RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 PROK2Q9HC23 129 aa13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 IGHV1-46P01743 117 aa13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 MDS2Q8NDY4 140 aa13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 PKDREJQ9NTG1 2253 aa13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 TRAV5A0A0B4J249 113 aa13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 LYPD6Q86Y78 171 aa13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM133Q9H2Q1 129 aa13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 MLNRO43193 412 aa13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 WFDC3Q8IUB2 231 aa13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 DLX6P56179 175 aa13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 PVRIGQ6DKI7 326 aa13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 C18orf15Q96N68 181 aa13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SNAI2O43623 268 aa13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 FOXH1O75593 365 aa13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SMIM13P0DJ93 91 aa13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 TM4SF20Q53R12 229 aa13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 DPF1Q92782 380 aa13.5□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 TFPI2P48307 235 aa13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 LINC00205P59089 165 aa13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 IGKV1D-33P01593 117 aa13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 IGKV1-33P01594 117 aa13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ARL17AQ8IVW1 177 aa13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 DOCK11Q5JSL3 2073 aa13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 A8MWP6 167 aa13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 S4R3C0 116 aa13.49□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 OR11H12B2RN74 326 aa13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 FNDC10F2Z333 226 aa13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP5LO75964 103 aa13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 PF4V1P10720 104 aa13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF726P1Q15940 193 aa13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 OR11H1Q8NG94 326 aa13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 OR11H2Q8NH07 326 aa13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ST20Q9HBF5 79 aa13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 H3BVH4 76 aa13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 DLEU1O43261 78 aa13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 IGKV1-39P01597 117 aa13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 IGKV1D-39P04432 117 aa13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR183P32249 361 aa13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 C10orf55Q5SWW7 151 aa13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 LMO1P25800 156 aa13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 C8orf46Q8TAG6 207 aa13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 RNF125Q96EQ8 232 aa13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SMIM12Q96EX1 92 aa13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 TYMSP04818 313 aa13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CD59P13987 128 aa13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 KLK15Q9H2R5 256 aa13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 FBXL7Q9UJT9 491 aa13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 PSG8Q9UQ74 426 aa13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 GPX1P07203 203 aa13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 HTN1P15515 57 aa13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP5G2Q06055 141 aa13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ARPC1AQ92747 370 aa13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 TNFRSF14Q92956 283 aa13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC25A15Q9Y619 301 aa13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM190Q8WZ59 177 aa13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM160Q9NX00 188 aa13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 MUC21A0A140T8X8 626 aa13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 A6NNC1 897 aa13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 MUC21Q5SSG8 566 aa13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 LINC01560Q8TB33 94 aa13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 NBR2O15453 112 aa13.46□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 SNCGO76070 127 aa13.46□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 CD33P20138 364 aa13.46□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 FBLN7Q53RD9 439 aa13.46□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 NEUROG1Q92886 237 aa13.46□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 C3orf79P0CE67 100 aa13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 TTC9CQ8N5M4 171 aa13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 SYT8Q8NBV8 401 aa13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 SSC4DQ8WTU2 575 aa13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 IGKV3-15P01624 115 aa13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 EBLN2Q6P2I7 272 aa13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 CACNA1HO95180 2353 aa13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM181BA6NEQ2 426 aa13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 ITGB1BP1O14713 200 aa13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 OR5AN1Q8NGI8 311 aa13.45□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 Q8NFD4 153 aa13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 HBDP02042 147 aa13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 COL4A3Q01955 1670 aa13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 Q0VG73 95 aa13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms