RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 OPRK1P41145 380 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP5G3P48201 142 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10A3P58181 314 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 IDNKQ5T6J7 187 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 LPCAT3Q6P1A2 487 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXI2Q6ZQN5 318 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZSN1 163 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 SSX7Q7RTT5 188 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC35G3Q8N808 338 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4B1Q8NGF8 309 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4C16Q8NGL9 310 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4X1Q8NH49 305 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 LGALS14Q8TCE9 139 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 CLUHP3Q96NS8 147 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 DIABLOQ9NR28 239 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 TPRKBQ9Y3C4 175 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAP1O75689 374 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV3-20P01619 116 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 H2AFB1P0C5Y9 115 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 H2AFB2P0C5Z0 115 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 PSG9Q00887 426 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 SFXN4Q6P4A7 337 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 C16orf54Q6UWD8 224 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 HOGA1Q86XE5 327 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5AP2Q8NGF4 316 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 OR1S2Q8NGQ3 325 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 FCAMRQ8WWV6 532 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 ABHD1Q96SE0 405 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 Q9H3A6 140 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 FKBP14Q9NWM8 211 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0A6YYH2 397 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 A6NJ64 397 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR31O00270 319 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMB9P28065 219 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP5CP53041 499 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP10-2P60368 255 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 FABP5Q01469 135 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 GLMPQ8WWB7 406 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 C17orf77Q96MU5 243 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00052Q96N35 136 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 MGLLQ99685 303 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 IFT46Q9NQC8 304 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 CBY3A6NI87 242 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 NOTOA8MTQ0 251 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 INS-IGF2F8WCM5 200 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 RGS10O43665 173 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFB130BP0DP73 79 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFB130AP0DP74 79 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A4P12235 298 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL5P46777 297 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMB3P49720 205 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 RORCP51449 518 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 SCAND1P57086 179 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 FXYD7P58549 80 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 TAS2R46P59540 309 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 DLK1P80370 383 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 ICAM4Q14773 271 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 ETFRF1Q6IPR1 90 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 NFE4Q86UQ8 179 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 NOXA1Q86UR1 476 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10J6PQ8NGY7 276 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF503Q96F45 646 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 EHFQ9NZC4 300 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV18A0A075B6X5 111 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0B4J293 547 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 SSX5O60225 188 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 INSP01308 110 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 IL4P05112 153 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPOP30536 169 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 S100A7P31151 101 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 MEOX2P50222 304 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 UPK3BQ9BT76 320 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 RPRMQ9NS64 109 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 RHBDL2Q9NX52 303 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 U3KQE9 123 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.49□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa5.49□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 BUB3O43684 328 aa5.49□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 FABP1P07148 127 aa5.49□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 GNAO1P09471 354 aa5.49□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 RD3LP0DJH9 198 aa5.49□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10J1P30954 320 aa5.49□□□□□ -1.53
PGGT1B-201ENST00000296642 AKR1C2P52895 323 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms