RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264389.6

COPS4-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS4, Length 1,744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4-201ENST00000264389 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.53□□□□□ -1.36
COPS4-201ENST00000264389 PFDN5Q99471 154 aa6.53□□□□□ -1.36
COPS4-201ENST00000264389 RNF2Q99496 336 aa6.53□□□□□ -1.36
COPS4-201ENST00000264389 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.53□□□□□ -1.36
COPS4-201ENST00000264389 ITPR3Q14573 2671 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 F8W036 122 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 G3V318 75 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 GNG7O60262 68 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 COX7A2P2O60397 106 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 CLN5O75503 358 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 SCGB2A1O75556 95 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 FABP1P07148 127 aa6.52□□□□□ -1.37
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COPS4-201ENST00000264389 IGLC1P0CG04 106 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 STAG3L2P0CL84 134 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 STAG3L3P0CL85 134 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 ADCYAP1P18509 176 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 IER3P46695 156 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 DEFA5Q01523 94 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 Q56UQ5 140 aa6.52□□□□□ -1.37
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COPS4-201ENST00000264389 RARRES2Q99969 163 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 MANBALQ9NQG1 85 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 DOK5Q9P104 306 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 FUT9Q9Y231 359 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 S4R3C0 116 aa6.52□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 LINC01548A6NM66 108 aa6.51□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 CD5LO43866 347 aa6.51□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 NDUFB8O95169 186 aa6.51□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 CXorf1O96002 111 aa6.51□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 APOC3P02656 99 aa6.51□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 NPBWR1P48145 328 aa6.51□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 PSMB3P49720 205 aa6.51□□□□□ -1.37
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COPS4-201ENST00000264389 TAS2R45P59539 299 aa6.51□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 ICAM4Q14773 271 aa6.51□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 TIGITQ495A1 244 aa6.51□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.51□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.51□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 Q6YL49 198 aa6.51□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.51□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.51□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.51□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.51□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.51□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.51□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 SEC11CQ9BY50 192 aa6.51□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.51□□□□□ -1.37
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COPS4-201ENST00000264389 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 PSMB11A5LHX3 300 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 C9JQL5 133 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 IGHG2P01859 326 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 IGF1P05019 195 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 RHOGP84095 191 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 VAX2Q9UIW0 290 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 PDZD2O15018 2839 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 AP4M1O00189 453 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 OR7C2O60412 319 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 TOMM40O96008 361 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 IGHV3-23P01764 117 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 PSG1P11464 419 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 CEBPGP53567 150 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 LYZP61626 148 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 BLCAPP62952 87 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 PMS2P11Q13670 270 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 C15orf32Q32M92 178 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 NECAP1Q8NC96 275 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.49□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.49□□□□□ -1.37
COPS4-201ENST00000264389 OR2T8A6NH00 312 aa6.49□□□□□ -1.37
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