RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 ZNF785A8K8V0 405 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 MMP23AO75900 390 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 GPX1P07203 203 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 PYYP10082 97 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 BMI1P35226 326 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 RAB9AP51151 201 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 BRWD1-AS2P59051 145 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 ZNF114Q8NC26 417 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 ZNF492Q9P255 531 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 ATRXP46100 2492 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 TMEM189A5PLL7 270 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 HIGD1CA8MV81 97 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 TCF21O43680 179 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 NPPCP23582 126 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 CT83Q5H943 113 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 ZFP30Q9Y2G7 519 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 DNAH12Q6ZR08 3092 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 IGKV1-16P04430 117 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 MYOD1P15172 320 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 ADIPOQQ15848 244 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 LINC00574Q9H8X3 128 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 GOSR1O95249 250 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 PCP4P48539 62 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 FAM215AQ9Y5M1 114 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 RNF224P0DH78 156 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 TOMM40O96008 361 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 DPM3Q9P2X0 92 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 DKK4Q9UBT3 224 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 A0A0G2JNJ9 132 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 FAM231BA6NCW3 169 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 J3QR89 54 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 ZNF137PP52743 207 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 MUC15Q8N387 334 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 ZNF738Q8NE65 137 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 Q9UFV3 132 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 NEU1Q99519 415 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 PRSS46E5RG02 174 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 K7EN84 100 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 CGB3P0DN86 165 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 CGB7P0DN87 165 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 ESDP10768 282 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 TMEM155Q4W5P6 130 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 C12orf54Q6X4T0 127 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 KAAG1Q9UBP8 84 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 BMPR1BO00238 502 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 HLA-DRB1P01911 266 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 GNG5P63218 68 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 FBXL15Q9H469 300 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 SVILO95425 2214 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 A0A1B0GUT8 65 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 GGTLC3B5MD39 225 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 APELAP0DMC3 54 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 NUP35Q8NFH5 326 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 LOC105371242A0A075B767 164 aa7.17□□□□□ -1.26
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HERC3-201ENST00000264345 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 NBR2O15453 112 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 TCRAP04437 139 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 PSMG4Q5JS54 123 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 KIR2DL5AQ8N109 375 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 RABAC1Q9UI14 185 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 CCL21O00585 134 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 FAM106CPP0CH98 169 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 TDGF1P3P51864 188 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 NHLH1Q02575 133 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.16□□□□□ -1.26
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