RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 MLNRO43193 412 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 FAM71F2Q6NXP2 309 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 Q6P435 159 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 C18orf15Q96N68 181 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 CD5P06127 495 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 TCF21O43680 179 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 CD7P09564 240 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 SPSB3Q6PJ21 355 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 WFDC1Q9HC57 220 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 TMEM8BA6NDV4 472 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 PPBPP02775 128 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 LINC00518Q8N0U6 118 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 OR10W1Q8NGF6 305 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 NEUROG1Q92886 237 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 NMSQ5H8A3 153 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 ATOH7Q8N100 152 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 TRGV11A0A075B6L2 103 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 OR10J3Q5JRS4 329 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 QRFPP83859 136 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 SCN8AQ9UQD0 1980 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 A0A1B0GWJ7 208 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 GGTLC1Q9BX51 225 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 MRAP2Q96G30 205 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 MUC21A0A140T8X8 626 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 TMEM50AO95807 157 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 HOXA5P20719 270 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 TMEM155Q4W5P6 130 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 MUC21Q5SSG8 566 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 ASCL4Q6XD76 172 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 RTTNQ86VV8 2226 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 STAG3L3P0CL85 134 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 TTC9CQ8N5M4 171 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 TRGV9Q99603 122 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 FOXC2Q99958 501 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 H0YJW9 148 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 SLC25A16P16260 332 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 ST20Q9HBF5 79 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 ESPL1Q14674 2120 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 K7ENP7 123 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 C1QTNF9P0C862 333 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 ARTNQ5T4W7 220 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 F2Z2F3 143 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 C15orf32Q32M92 178 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 TMEM170AQ8WVE7 144 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 C5orf63A6NC05 138 aa15.58■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 PLP1P60201 277 aa15.58■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 COTL1Q14019 142 aa15.58■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 C5orf64Q2M2E5 130 aa15.58■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa15.58■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 SMIM13P0DJ93 91 aa15.58■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 GLRX5Q86SX6 157 aa15.58■□□□□ 0.09
PTPRE-201ENST00000254667 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 IGKV1-5P01602 117 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 C3orf36Q3SXR2 165 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 C10orf55Q5SWW7 151 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 COQ2Q96H96 371 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 FREM3P0C091 2139 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 DPH3Q96FX2 82 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF585BQ52M93 769 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 DNAL4O96015 105 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 IGFL3Q6UXB1 125 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 OR5AN1Q8NGI8 311 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 ITGB1BP1O14713 200 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 LILRA1O75019 489 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 TSKUQ8WUA8 353 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 GLMPQ8WWB7 406 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 GCSAMLQ5JQS6 135 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 OCC1Q8TAD7 63 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 KLRD1Q13241 179 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 OR13C6PQ8NH95 151 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 CLDN16Q9Y5I7 305 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 LINC01549A6NIU2 74 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 NDUFS8O00217 210 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 PSG1P11464 419 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 TEX38Q6PEX7 206 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 A0A1B0GW64 132 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 GTSCR1Q86UQ5 136 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP15.55■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 GNB1LQ9BYB4 327 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRE-201ENST00000254667 USMG5Q96IX5 58 aa15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms