RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027988.7

Ccdc3-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc3, Length 2,670 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Olfr435Q8VFS3 313 aa15.49■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Olfr979Q8VH10 311 aa15.49■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Chrdl1Q920C1 447 aa15.49■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 FrkQ922K9 512 aa15.49■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ccdc198Q9CPZ1 294 aa15.49■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Olfr418A0A140T8J6 310 aa15.49■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Samt1A2BED8 237 aa15.49■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Gm15140A2BEE3 237 aa15.49■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Vmn1r114L7N226 321 aa15.49■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Vmn1r126L7N2C8 321 aa15.49■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Idh3gP70404 393 aa15.49■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Zfp799Q8BHK4 648 aa15.49■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Olfr1412Q8VET3 321 aa15.49■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Stard4Q99JV5 224 aa15.49■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Slc50a1Q9CXK4 221 aa15.49■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Hoxa5P09021 270 aa15.48■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Fgf2P15655 154 aa15.48■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Cd82P40237 266 aa15.48■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Olfr1290Q7TQX8 312 aa15.48■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Pla2g16Q8R3U1 162 aa15.48■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Mib2Q8R516 973 aa15.48■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Rab40cQ8VHQ4 281 aa15.48■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Bbc3Q99ML1 193 aa15.48■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Sfrp4Q9Z1N6 351 aa15.48■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Usf3B2RUQ2 2221 aa15.48■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Kdf1A2A9F4 397 aa15.48■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Wdr86D3Z757 380 aa15.48■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Gm3486L7N2D0 199 aa15.48■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Alox12bO70582 701 aa15.48■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 VhlP40338 181 aa15.48■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Rab2aP53994 212 aa15.48■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Taar8bQ5QD06 344 aa15.48■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Tob1Q61471 362 aa15.48■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Gm45844A0A1B0GRQ2 137 aa15.47■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Pfdn2O70591 154 aa15.47■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Defa-rs2P17534 91 aa15.47■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Dhrs2Q149L0 282 aa15.47■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Fam160a2Q3U2I3 975 aa15.47■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Cyb561Q60720 250 aa15.47■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Smco3Q8BQM7 225 aa15.47■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Gpr4Q8BUD0 365 aa15.47■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Olfr1030Q8VFL5 318 aa15.47■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Olfr116Q923Q6 321 aa15.47■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Chst4Q9R1I1 388 aa15.47■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Syngr4Q9Z1L2 233 aa15.47■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Gm21746J3QMM6 180 aa15.47■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ca11O70354 328 aa15.47■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 OsmP53347 263 aa15.47■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Gm10447Q3UQ92 135 aa15.47■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 NracQ8BNX7 165 aa15.47■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Henmt1Q8CAE2 395 aa15.47■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Olfr1054Q8VGS7 312 aa15.47■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Olfr926Q9EQ98 308 aa15.47■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 NgbQ9ER97 151 aa15.47■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 SrfQ9JM73 504 aa15.47■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 PkdrejQ9Z0T6 2126 aa15.47■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Pglyrp3A1A547 347 aa15.46■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Psg27Q497W2 474 aa15.46■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 SlaQ60898 281 aa15.46■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Gm5771Q792Y9 245 aa15.46■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Olfr907Q7TRC7 310 aa15.46■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Pgam5Q8BX10 288 aa15.46■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Olfr484Q8VFD3 321 aa15.46■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Olfr1155Q8VFR3 314 aa15.46■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Olfr362Q8VGV7 317 aa15.46■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 S1pr5Q91X56 400 aa15.46■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Pip4p2Q9CZX7 257 aa15.46■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Cacna1gQ5SUF7 2381 aa15.46■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Arl16B1ATY8 173 aa15.46■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 3110082J24RikF6Z6Z2 108 aa15.46■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Gm20877J3QPZ4 227 aa15.46■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Olfr141Q60880 325 aa15.46■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Olfr167Q8VGJ5 312 aa15.46■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Efcab10Q9D581 132 aa15.46■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Olfr894Q9EQB2 313 aa15.46■□□□□ 0.07
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 1700025C18RikA2A580 89 aa15.45■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Olfr913E9Q716 312 aa15.45■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Mpv17P19258 176 aa15.45■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 PjvkQ0ZLH2 352 aa15.45■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Vdac1Q60932 296 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Lhfpl2Q8BGA2 222 aa15.45■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Olfr1202Q8VF98 309 aa15.45■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Mrpl27Q99N92 148 aa15.45■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Dda1Q9D9Z5 102 aa15.45■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Trex2Q9R1A9 236 aa15.45■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Aifm1Q9Z0X1 612 aa15.45■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Med13Q5SWW4 2171 aa15.45■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Bcat2O35855 393 aa15.45■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 KrasP32883 189 aa15.45■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 MpgQ04841 333 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Lrrc30Q3UV48 300 aa15.45■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 HykkQ5U5V2 376 aa15.45■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Olfr94Q6UAH0 386 aa15.45■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Mtch2Q791V5 303 aa15.45■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Polr3kQ9CQZ7 108 aa15.45■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Trav18A0A075B656 109 aa15.44■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Gm21778A0A087WNP8 232 aa15.44■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Gm21616B6ZB74 166 aa15.44■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Gm21789J3QMZ1 123 aa15.44■□□□□ 0.06
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Gm21972J3QN38 98 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 56.8 ms