RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635893.1

SCN1A-211, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene SCN1A, Length 168 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1A-211ENST00000635893 PKHD1P08F94 4074 aa-1.03□□□□□ -2.57
SCN1A-211ENST00000635893 EPG5Q9HCE0 2579 aa-1.03□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 RIC1Q4ADV7 1423 aa-1.04□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa-1.04□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 PQLC2LA1A4F0 135 aa-1.04□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 GOLGA8MH3BSY2 632 aa-1.04□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 DDTP30046 118 aa-1.04□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 OR5L1Q8NGL2 311 aa-1.04□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 ROPN1LQ96C74 230 aa-1.04□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa-1.04□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 TAS2R7Q9NYW3 318 aa-1.04□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 EPDR1Q9UM22 224 aa-1.04□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 TET1Q8NFU7 2136 aa-1.04□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 LOC285556D6RIA3 1793 aa-1.05□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa-1.05□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa-1.05□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 PROSCO94903 275 aa-1.05□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 RD3LP0DJH9 198 aa-1.05□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 COX6A1P12074 109 aa-1.05□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 SPRR2DP22532 72 aa-1.05□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 CALRP27797 417 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 KDELR2P33947 212 aa-1.05□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 KCNJ3P48549 501 aa-1.05□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 CARD18P57730 90 aa-1.05□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 FXYD6P3P58550 94 aa-1.05□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 LINC01554Q52M75 96 aa-1.05□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 PXT1Q8NFP0 134 aa-1.05□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 PSMF1Q92530 271 aa-1.05□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 MIXL1Q9H2W2 232 aa-1.05□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 PSTPIP2Q9H939 334 aa-1.05□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 C14orf105Q9NVL8 296 aa-1.05□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 TP73-AS1Q9UF72 201 aa-1.05□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 A0A0J9YY10 115 aa-1.06□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa-1.06□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 A0A1B0GX78 115 aa-1.06□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 NDUFS8O00217 210 aa-1.06□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 GUK1Q16774 197 aa-1.06□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 GLT8D1Q68CQ7 371 aa-1.06□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 IQCF2Q8IXL9 164 aa-1.06□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 GPR32P1Q8NGA4 272 aa-1.06□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 MCFD2Q8NI22 146 aa-1.06□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 C1orf109Q9NX04 203 aa-1.06□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 MED29Q9NX70 200 aa-1.06□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 HS3ST2Q9Y278 367 aa-1.06□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 DNHD1Q96M86 4753 aa-1.06□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa-1.06□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa-1.07□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 CHD6Q8TD26 2715 aa-1.07□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 IGKV1-5P01602 117 aa-1.07□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 CASQ1P31415 396 aa-1.07□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 MAP2K4P45985 399 aa-1.07□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 SLAMF1Q13291 335 aa-1.07□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 CDKL4Q5MAI5 379 aa-1.07□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 SPANXN3Q5MJ09 141 aa-1.07□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 LYG2Q86SG7 212 aa-1.07□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 BOD1L2Q8IYS8 172 aa-1.07□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 OR10AC1Q8NH08 325 aa-1.07□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 TERB2Q8NHR7 220 aa-1.07□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 JOSD2Q8TAC2 188 aa-1.07□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 DNAJC9Q8WXX5 260 aa-1.07□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 PLAC4Q8WY50 150 aa-1.07□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP-1.07□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 TOPBP1Q92547 1522 aa-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 HLA-DRAP01903 254 aa-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 HIST1H2BOP23527 126 aa-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 HIST1H2BBP33778 126 aa-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 HIST1H2BDP58876 126 aa-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 HIST1H2BCP62807 126 aa-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 IFITM2Q01629 132 aa-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 HIST2H2BEQ16778 126 aa-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 DNM1P34Q6PK57 102 aa-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 MIR17HGQ75NE6 70 aa-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 HIST1H2BHQ93079 126 aa-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 MSANTD3Q96H12 275 aa-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 HIST1H2BNQ99877 126 aa-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 HIST1H2BMQ99879 126 aa-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 FKBP14Q9NWM8 211 aa-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 DKKL1Q9UK85 242 aa-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 KNTC1P50748 2209 aa-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-1.08□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 CELSR2Q9HCU4 2923 aa-1.09□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 DISC1C4P0D8 188 aa-1.09□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 FTCDNL1E5RQL4 147 aa-1.09□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 SMLR1H3BR10 107 aa-1.09□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 OR2B3O76000 313 aa-1.09□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 ORM1P02763 201 aa-1.09□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 IL3P08700 152 aa-1.09□□□□□ -2.58
SCN1A-211ENST00000635893 PRR15Q8IV56 129 aa-1.09□□□□□ -2.58
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