RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 GABARAPL2P60520 117 aa19.68■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM230Q96A57 120 aa19.68■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 MRGPRFQ96AM1 343 aa19.68■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa19.68■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 VCX3BQ9H321 246 aa19.68■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa19.67■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP5CP53041 499 aa19.67■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMG4Q5JS54 123 aa19.67■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D26Q86UD7 250 aa19.67■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC35G3Q8N808 338 aa19.67■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa19.67■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 MUC4Q99102 2169 aa19.67■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 SCGB2A1O75556 95 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 DHRS2Q13268 280 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 SOHLH1Q5JUK2 328 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 FCGR1BQ92637 280 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV1-39P01597 117 aa19.65■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV1D-39P04432 117 aa19.65■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 SPARTQ8N0X7 666 aa19.65■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 DCANP1Q8TF63 244 aa19.65■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB40CQ96S21 281 aa19.65■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa19.65■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 XCL2Q9UBD3 114 aa19.65■□□□□ 0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 CRYBB3P26998 211 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPAN5P62079 268 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 LPCAT3Q6P1A2 487 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 ANAPC10Q9UM13 185 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 PKD1P98161 4303 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 HELTA6NFD8 242 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 HLA-DMAP28067 261 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 HRH1P35367 487 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 KCTD21Q4G0X4 260 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM69Q5SWH9 247 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 CORTO00230 105 aa19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 OPRK1P41145 380 aa19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP19.62■□□□□ 0.732e-6■■■□□ 18.2
CAPNS1-217ENST00000629983 EMP1P54849 157 aa19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 AGRNO00468 2067 aa19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 CLN5O75503 358 aa19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 TAS2R20P59543 309 aa19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 PDCD10Q9BUL8 212 aa19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 NAT1P18440 290 aa19.6■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 ENY2Q9NPA8 101 aa19.6■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 SPART-AS1P0CW21 52 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 TIGITQ495A1 244 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZRM9 215 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS3P35030 304 aa19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 AKR1C2P52895 323 aa19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2NLQ5JXB2 153 aa19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZR54 194 aa19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 CD74P04233 296 aa19.57■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 MLANAQ16655 118 aa19.57■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4X1Q8NH49 305 aa19.57■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa19.56■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 HTN3P15516 51 aa19.56■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf134Q5TEV5 83 aa19.56■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 LYSMD2Q8IV50 215 aa19.56■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 SAMD12Q8N8I0 201 aa19.56■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB26Q9ULW5 256 aa19.56■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM189A5PLL7 270 aa19.54■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 INS-IGF2F8WCM5 200 aa19.54■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM127O75204 238 aa19.54■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV1-17P01599 117 aa19.54■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 ETV6P41212 452 aa19.54■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 C16orf54Q6UWD8 224 aa19.54■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM210BQ96KR6 192 aa19.54■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0B4J293 547 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM90A26D6RGX4 464 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BMM0 161 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV1-5P01602 117 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 PGAM2P15259 253 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 Q8WTZ3 238 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 GLMPQ8WWB7 406 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 FXYD7P58549 80 aa19.52■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 U3KQE9 123 aa19.52■□□□□ 0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-217ENST00000629983 C16orf90A8MZG2 172 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-217ENST00000629983 ATG12O94817 140 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV3-20P01619 116 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-217ENST00000629983 UCP3P55916 312 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-217ENST00000629983 CROCCP3Q8IVE0 287 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-217ENST00000629983 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-217ENST00000629983 NEU1Q99519 415 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-217ENST00000629983 NRN1Q9NPD7 142 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-217ENST00000629983 RFNGQ9Y644 331 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-217ENST00000629983 HSPG2P98160 4391 aa19.51■□□□□ 0.71
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