RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613916.1

PVT1-222, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 137 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-222	ENST00000613916	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916		Q6YL49	198 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916		Q6ZRG5	221 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	RPRM	Q9NS64	109 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	SMCO3	A2RU48	225 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	UMAD1	C9J7I0	102 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	TEX46	H3BTG2	121 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916		I3L2K1	104 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916		K7EIM0	57 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	AGPAT2	O15120	278 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	TCF21	O43680	179 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	MPDU1	O75352	247 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	YIF1A	O95070	293 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	IGHV3-48	P01763	117 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	PRH1	P02810	166 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	LINC00869	P0C866	280 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	RAB5C	P51148	216 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	BLOC1S1	P78537	153 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF726P1	Q15940	193 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	TEPP	Q6URK8	271 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916		Q6ZS46	218 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	SSX7	Q7RTT5	188 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	COMMD7	Q86VX2	200 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	THAP8	Q8NA92	274 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	LFNG	Q8NES3	379 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	PARP11	Q9NR21	331 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916		G3V318	75 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	MT-CO2	P00403	227 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	IGHG2	P01859	326 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	HNF1A	P20823	631 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	OR10J1	P30954	320 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	OPRK1	P41145	380 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	CAMLG	P49069	296 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	RAB2A	P61019	212 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	BLCAP	P62952	87 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	PRR20E	P86478	221 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	PRR20C	P86479	221 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	PRR20D	P86480	221 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	PRR20B	P86481	221 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	PRR20A	P86496	221 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	AKR1C1	Q04828	323 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	PRR31	Q5SQ13	230 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	MIC13	Q5XKP0	118 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	OR5T1	Q8NG75	326 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	NPIPB3	Q92617	1050 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	MISP3	Q96FF7	219 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	SLC35E1	Q96K37	410 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	PSMB11	A5LHX3	300 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916		F8W735	103 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916		M0QZK8	103 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	CORT	O00230	105 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	SOX15	O60248	233 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	NDUFB8	O95169	186 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	IGF1	P05019	195 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	DEFA4	P12838	97 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	RND2	P52198	227 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	CCL20	P78556	96 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	STPG3	Q8N7X2	389 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF709	Q8N972	641 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PVT1-222	ENST00000613916	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		5.73	□□□□□ -1.49

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