RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611848.1

SMAD4-217, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SMAD4, Length 1,648 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-217ENST00000611848 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 DNHD1Q96M86 4753 aa6.99□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 C15orf61A6NNL5 157 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 H7C2Y5 167 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 J3QL48 77 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 IFNA17P01571 189 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 MBP02144 154 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 APOA2P02652 100 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 PF4P02776 101 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 AMY1AP04745 511 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 SSX9Q7RTT3 188 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 GGACTQ9BVM4 153 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 PRSS46E5RG02 174 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 HRASP01112 189 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 BCL2P10415 239 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 FGF7P21781 194 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 MMDQ15546 238 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 SPINK9Q5DT21 86 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 OR4A47Q6IF82 309 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 ACSM6Q6P461 480 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 LCN15Q6UWW0 184 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 Q6ZS46 218 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 PDPNQ86YL7 162 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 Q8N9W7 124 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 CLCC1Q96S66 551 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.98□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 TNCP24821 2201 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 H3BQ15 152 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 M0R036 132 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 NBR2O15453 112 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 SOX15O60248 233 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 FOLR2P14207 255 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 SMUG1Q53HV7 270 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 NPBQ8NG41 125 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 P2RX4Q99571 388 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 GNG13Q9P2W3 67 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.97□□□□□ -1.29
SMAD4-217ENST00000611848 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 RRHO14718 337 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 MPDU1O75352 247 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 NDUFA3O95167 84 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 IFNA10P01566 189 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 IGHG2P01859 326 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 CTRB1P17538 263 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 MAS1LP35410 378 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 LGALS7P47929 136 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 DLK1P80370 383 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 RTL8BQ17RB0 113 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF709Q8N972 641 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 RITA1Q96K30 269 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 CITED1Q99966 193 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 VAX2Q9UIW0 290 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 A0A087WWC5 75 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 UPK2O00526 184 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-217ENST00000611848 IFNA1P01562 189 aa6.95□□□□□ -1.3
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