RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 NPBWR1P48145 328 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 LPCAT3Q6P1A2 487 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 CROCCP3Q8IVE0 287 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 C4BPBP20851 252 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS19P39019 145 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPAN5P62079 268 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6ZTC4 211 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM50AO95807 157 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 GPX8Q8TED1 209 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 X6R8D5 127 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 KNCNA6PVL3 124 aa18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 K7EQG2 157 aa18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 MIFP14174 115 aa18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 STXBP6Q8NFX7 210 aa18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM231Q9H6L2 316 aa18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 FAT2Q9NYQ8 4349 aa18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 UCP3P55916 312 aa18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 PVRIGQ6DKI7 326 aa18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV10A0A0B4J240 114 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV1-5P01602 117 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF688P0C7X2 276 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 SPP1P10451 314 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 NPPCP23582 126 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 SNCAP37840 140 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM41BQ5BJD5 291 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 INS-IGF2F8WCM5 200 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP5CP53041 499 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00299Q6ZSB3 139 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35G3Q8N808 338 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 GRAMD2BQ96HH9 432 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC5AQ9NY25 188 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAH2Q9P225 4427 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0B4J293 547 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PS18 150 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 P0C879 139 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CRYBB3P26998 211 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 P2RY1P47900 373 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 DCANP1Q8TF63 244 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL26Q96S19 204 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GVY2 172 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CLN5O75503 358 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 MLANAQ16655 118 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTL10Q5JWF8 245 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00336Q6ZUF6 198 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX29P2Q8IUI4 249 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CELA1Q9UNI1 258 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CORTO00230 105 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 IFNA17P01571 189 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 PI3P19957 117 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 RCVRNP35243 200 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 RORCP51449 518 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 TP53RKQ96S44 253 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 M0QYG6 137 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ETV6P41212 452 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 AKR1C2P52895 323 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 RND3P61587 244 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF767PQ75MW2 155 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4X1Q8NH49 305 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF126Q9BV68 326 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 SCPEP1Q9HB40 452 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D24Q9ULP9 559 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 OPRK1P41145 380 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.553e-6■■□□□ 14.2
CAPNS1-211ENST00000590874 MCFD2Q8NI22 146 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM230Q96A57 120 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 COMMD3Q9UBI1 195 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV1-17P01599 117 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 PGAM2P15259 253 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 C12orf74Q32Q52 190 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 TIGITQ495A1 244 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 AP3S1Q92572 193 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 PDCD10Q9BUL8 212 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 AMBPP02760 352 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 PIGPP57054 158 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 CENPSQ8N2Z9 138 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 SCRT1Q9BWW7 348 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 PKHD1P08F94 4074 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0G2JRQ6 117 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 APOA1P02647 267 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 BSXQ3C1V8 233 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMG4Q5JS54 123 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB40CQ96S21 281 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 U3KQE9 123 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-211ENST00000590874 AGRNO00468 2067 aa18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms