RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		19.1	■□□□□ 0.65
GPS1-223	ENST00000584229	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		19.1	■□□□□ 0.65
GPS1-223	ENST00000584229	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	19.1	■□□□□ 0.65
GPS1-223	ENST00000584229	ALG5	Q9Y673	324 aa		19.1	■□□□□ 0.65
GPS1-223	ENST00000584229	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		19.09	■□□□□ 0.65
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF320	A2RRD8	509 aa		19.09	■□□□□ 0.65
GPS1-223	ENST00000584229	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	19.09	■□□□□ 0.65
GPS1-223	ENST00000584229	SIX6	O95475	246 aa		19.09	■□□□□ 0.65
GPS1-223	ENST00000584229	NPBWR1	P48145	328 aa		19.09	■□□□□ 0.65
GPS1-223	ENST00000584229	MLANA	Q16655	118 aa		19.09	■□□□□ 0.65
GPS1-223	ENST00000584229	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		19.09	■□□□□ 0.65
GPS1-223	ENST00000584229	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		19.09	■□□□□ 0.65
GPS1-223	ENST00000584229	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		19.09	■□□□□ 0.65
GPS1-223	ENST00000584229	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		19.09	■□□□□ 0.65
GPS1-223	ENST00000584229	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		19.09	■□□□□ 0.65
GPS1-223	ENST00000584229	PEMT	Q9UBM1	199 aa		19.09	■□□□□ 0.65
GPS1-223	ENST00000584229	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	19.09	■□□□□ 0.65
GPS1-223	ENST00000584229		F8W735	103 aa	Predicted RBP	19.08	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	19.08	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		19.08	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		19.08	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	OR4C12	Q96R67	309 aa		19.08	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	TXN2	Q99757	166 aa		19.08	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		19.08	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	19.08	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	C15orf62	A8K5M9	175 aa		19.07	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229		L7N2F9	121 aa		19.07	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	SCGB2A1	O75556	95 aa		19.07	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	LY86	O95711	162 aa		19.07	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	VAMP2	P63027	116 aa		19.07	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	ATP6V0B	Q99437	205 aa		19.07	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	19.06	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		19.06	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	ACY3	Q96HD9	319 aa		19.06	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		19.06	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		19.05	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	SLC25A4	P12235	298 aa		19.05	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	RND2	P52198	227 aa		19.05	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	19.05	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	GPHB5	Q86YW7	130 aa		19.05	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	RAB40C	Q96S21	281 aa		19.05	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	19.05	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		19.04	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	C7orf66	A4D0T2	115 aa		19.04	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229		K7EPK0	472 aa		19.04	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	YIF1A	O95070	293 aa		19.04	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	19.04	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	ADM	P35318	185 aa		19.04	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	CD69	Q07108	199 aa		19.04	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	OR4X1	Q8NH49	305 aa		19.04	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	SLC35E1	Q96K37	410 aa		19.04	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		19.04	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		19.03	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	CLN5	O75503	358 aa		19.03	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	CTSG	P08311	255 aa		19.03	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	19.03	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	BCAP31	P51572	246 aa		19.03	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	RAB32	Q13637	225 aa		19.03	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		19.03	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	REC114	Q7Z4M0	266 aa		19.03	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		19.03	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	SMIM8	Q96KF7	97 aa		19.03	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		19.02	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		19.02	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		19.02	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		19.02	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	19.02	■□□□□ 0.64
GPS1-223	ENST00000584229	LGALS9	O00182	355 aa		19.01	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	NDUFA4	O00483	81 aa		19.01	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM50A	O95807	157 aa		19.01	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	INSL3	P51460	131 aa		19.01	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		19.01	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	NPIPB3	Q92617	1050 aa		19.01	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		19.01	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		19	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	PAX9	P55771	341 aa		19	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	OXA1L	Q15070	435 aa		19	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	TIGIT	Q495A1	244 aa		19	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		19	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	NMES1	Q9C002	83 aa		19	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	MED28	Q9H204	178 aa		19	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	C2orf70	A6NJV1	201 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	TSC22D2	O75157	780 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	CSN3	P07498	182 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	EDN2	P20800	178 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	OR10J1	P30954	320 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	CAV2	P51636	162 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	TAS2R30	P59541	319 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	TM4SF20	Q53R12	229 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		18.99	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	SMCO3	A2RU48	225 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	H2BFS	P57053	126 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		18.98	■□□□□ 0.63
GPS1-223	ENST00000584229		A8MWP6	167 aa		18.97	■□□□□ 0.63

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