RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577256.5

ATG13-223, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 4

Gene ATG13, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-223	ENST00000577256	GUCA2B	Q16661	112 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ATG13-223	ENST00000577256	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ATG13-223	ENST00000577256	C2orf83	Q53S99	150 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ATG13-223	ENST00000577256	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ATG13-223	ENST00000577256	BTNL8	Q6UX41	500 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ATG13-223	ENST00000577256	NOXA1	Q86UR1	476 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ATG13-223	ENST00000577256	OR1S1	Q8NH92	325 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ATG13-223	ENST00000577256	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATG13-223	ENST00000577256		A6NHS1	94 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATG13-223	ENST00000577256	SCGB2A1	O75556	95 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATG13-223	ENST00000577256	NXPH3	O95157	252 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATG13-223	ENST00000577256	SLC25A6	P12236	298 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATG13-223	ENST00000577256	CD81	P60033	236 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATG13-223	ENST00000577256	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
ATG13-223	ENST00000577256	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
ATG13-223	ENST00000577256	ASCL2	Q99929	193 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATG13-223	ENST00000577256	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
ATG13-223	ENST00000577256	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATG13-223	ENST00000577256	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ATG13-223	ENST00000577256	YIF1A	O95070	293 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	NPY1R	P25929	384 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	BTC	P35070	178 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	OR4X1	Q8NH49	305 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	DTD1	Q8TEA8	209 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	OR10C1	Q96KK4	312 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	NEURL2	Q9BR09	285 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	CCDC32	Q9BV29	185 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256		U3KQ87	197 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	PITX3	O75364	302 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	CLN5	O75503	358 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM50A	O95807	157 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	S100Z	Q8WXG8	99 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	GINS3	Q9BRX5	216 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	RBKS	Q9H477	322 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	TUBA4B	Q9H853	241 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256		U3KQK5	164 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	C9orf170	A2RU37	121 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	LYRM1	O43325	122 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	IFNA10	P01566	189 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	SLC25A4	P12235	298 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	SMPX	Q9UHP9	88 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	PLA2G10	O15496	165 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	MED6	O75586	246 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	HOXB5	P09067	269 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	CD7	P09564	240 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	OR4E1	P0C645	316 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	DHRS2	Q13268	280 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	MLANA	Q16655	118 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	LYG2	Q86SG7	212 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	COQ8A	Q8NI60	647 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	BMI1	P35226	326 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	C4orf46	Q504U0	113 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	13.23	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	OR11H12	B2RN74	326 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	TSPAN4	O14817	238 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	ZMAT4	Q9H898	229 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	CHEK1	O14757	476 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	IFNA21	P01568	189 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	IFNA4	P05014	189 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	RND2	P52198	227 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ATG13-223	ENST00000577256	IGKV1-17	P01599	117 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATG13-223	ENST00000577256	CD5	P06127	495 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATG13-223	ENST00000577256	IGLC1	P0CG04	106 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATG13-223	ENST00000577256	DEFB125	Q8N687	156 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATG13-223	ENST00000577256	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATG13-223	ENST00000577256	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ATG13-223	ENST00000577256	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3

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