RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559312.5

NUMB-231, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-231	ENST00000559312	FAM223B	A6NKX1	122 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	MPTX1	A8MV57	137 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	NPS	P0C0P6	89 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	CD28	P10747	220 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	SNCA	P37840	140 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	KRTAP10-3	P60369	221 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	FAM209B	Q5JX69	171 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	OR2C3	Q8N628	320 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	NECAP1	Q8NC96	275 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	OR1P1	Q8NH06	330 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	C2orf50	Q96LR7	162 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	C5orf51	A6NDU8	294 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	FAM25E	A8MYX2	175 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	SYNGR2	O43760	224 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	SSNA1	O43805	119 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	TRGV3	P03979	118 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	REG1A	P05451	166 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	HTR2B	P41595	481 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	TIRAP	P58753	221 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	TPPP2	P59282	170 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	BSX	Q3C1V8	233 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	NOXA1	Q86UR1	476 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	DTD1	Q8TEA8	209 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	OR10C1	Q96KK4	312 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	RBKS	Q9H477	322 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	ALG5	Q9Y673	324 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312		U3KQ87	197 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312		M0QZ24	198 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	CORT	O00230	105 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	WRB	O00258	174 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	CCS	O14618	274 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	RHOG	P84095	191 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	RUNX1	Q01196	453 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	IL15RA	Q13261	267 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	C15orf32	Q32M92	178 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	C2orf83	Q53S99	150 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	SPINK9	Q5DT21	86 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	CXorf58	Q96LI9	332 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	MS4A10	Q96PG2	267 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	ATP6V0B	Q99437	205 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	P2RX4	Q99571	388 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	NMES1	Q9C002	83 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	MED28	Q9H204	178 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	GOSR2	O14653	212 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	OR2J3	O76001	311 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	JTB	O76095	146 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	PRH1	P02810	166 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	NPY1R	P25929	384 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	TAS2R30	P59541	319 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	ATP5G2	Q06055	141 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	ASB13	Q8WXK3	278 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	OR4F4	Q96R69	305 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	PRR25	Q96S07	402 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	RAB40C	Q96S21	281 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312		I3L521	148 aa		5.79	□□□□□ -1.48

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