RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557640.1

RD3L-201, Transcript of retinal degeneration 3 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene RD3L, Length 1,201 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3L-201ENST00000557640 TSPAN4O14817 238 aa5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 KBTBD11O94819 623 aa5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 CRYGCP07315 174 aa5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 RPA2P15927 270 aa5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 DEFA1P59665 94 aa5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 DEFA3P59666 94 aa5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 TSPAN5P62079 268 aa5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 MSMO1Q15800 293 aa5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 MZT2BQ6NZ67 158 aa5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 SLC25A42Q86VD7 318 aa5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 STPG3Q8N7X2 389 aa5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 Q8NAQ8 132 aa5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 C11orf45Q8TAV5 145 aa5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 CD300LFQ8TDQ1 290 aa5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 SPIN2AQ99865 258 aa5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 GINS4Q9BRT9 223 aa5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 SLC5A7Q9GZV3 580 aa5.75□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 TRAV6A0A075B6T7 132 aa5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 IGLC7A0M8Q6 106 aa5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 CENPXA8MT69 81 aa5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 IGLL5B9A064 214 aa5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 FCGR3BO75015 233 aa5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 PSMB6P28072 239 aa5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 FAUP35544 74 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 INPP1P49441 399 aa5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 MFAP2P55001 183 aa5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 FXYD4P59646 89 aa5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 RND3P61587 244 aa5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 ANKRD55Q3KP44 614 aa5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 Q6ZTC4 211 aa5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 KCTD9Q7L273 389 aa5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 MMD2Q8IY49 270 aa5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 C2CD4CQ8TF44 421 aa5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 CHRDL1Q9BU40 450 aa5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 C20orf85Q9H1P6 137 aa5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 SLC2A9Q9NRM0 540 aa5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 NUDT15Q9NV35 164 aa5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa5.74□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 TRAV3A0A0B4J244 114 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 C7orf66A4D0T2 115 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 GPR31O00270 319 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 IGKV1-39P01597 117 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 IGKV1D-39P04432 117 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 IL5P05113 134 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 CLEC3BP05452 202 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 RRASP10301 218 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 HERV-K104P61576 105 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 CBX3Q13185 183 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 FAM106AQ4KMX7 169 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 PHLDA2Q53GA4 152 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 OR4A47Q6IF82 309 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 TMEM17Q86X19 198 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 SLC38A6Q8IZM9 456 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 FAM24BQ8N5W8 94 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 TMEM217Q8N7C4 229 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 ZNF645Q8N7E2 425 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 OR11H2Q8NH07 326 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 SECTM1Q8WVN6 248 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 MARC2Q969Z3 335 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 GALNT14Q96FL9 552 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 RARRES2Q99969 163 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 COPZ2Q9P299 210 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 CELA1Q9UNI1 258 aa5.73□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa5.72□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa5.72□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa5.72□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 C9orf170A2RU37 121 aa5.72□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 OR2T8A6NH00 312 aa5.72□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 M0R2N4 97 aa5.72□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 TGOLN2O43493 480 aa5.72□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 TNFSF12O43508 249 aa5.72□□□□□ -1.49
RD3L-201ENST00000557640 ACTL6BO94805 426 aa5.72□□□□□ -1.49
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