RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553944.2

ACTN1-AS1-201, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 484 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SMCO3A2RU48 225 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PSMB11A5LHX3 300 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FAM223BA6NKX1 122 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 I3L2K1 104 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SOX15O60248 233 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SCGB2A1O75556 95 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IGLV1-40P01703 118 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IGHG4P01861 327 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CFHR3Q02985 330 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 AKR1C1Q04828 323 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GAMTQ14353 236 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TEX38Q6PEX7 206 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TEPPQ6URK8 271 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ST8SIA2Q92186 375 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 USMG5Q96IX5 58 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CXorf58Q96LI9 332 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TXN2Q99757 166 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GINS3Q9BRX5 216 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ARV1Q9H2C2 271 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.61□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 A0A0G2JLM5 398 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 K7EIM0 57 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 OR2J3O76001 311 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NDUFB8O95169 186 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NDUFA7O95182 113 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PRH1P02810 166 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRGV3P03979 118 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ELANEP08246 267 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SEC11BP0C7V7 166 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PF4V1P10720 104 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NPBWR1P48145 328 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RAB9AP51151 201 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MFAP4P55083 255 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RHOGP84095 191 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ATP5G2Q06055 141 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MLANAQ16655 118 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FAM209BQ5JX69 171 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ACSM6Q6P461 480 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 BTNL8Q6UX41 500 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TREML4Q6UXN2 200 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZNF709Q8N972 641 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 OR4X1Q8NH49 305 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ACY3Q96HD9 319 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MS4A10Q96PG2 267 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ATP6V0BQ99437 205 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.6□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CLN5O75503 358 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IFNA7P01567 189 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FABP1P07148 127 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FGF7P21781 194 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ATP6V0CP27449 155 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PSMB8P28062 276 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CAMLGP49069 296 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TPPP2P59282 170 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SELENOTP62341 195 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SERF2P84101 59 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FOXE3Q13461 319 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C15orf32Q32M92 178 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TEX261Q6UWH6 196 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 THAP8Q8NA92 274 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 OR4F5Q8NH21 305 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NPIPB3Q92617 1050 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 A0A1B0GUS0 222 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZFP92A6NM28 416 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GNG7O60262 68 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SPP1P10451 314 aa6.58□□□□□ -1.36
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms