RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552433.1

LETMD1-233, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 2

Gene LETMD1, Length 727 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-233	ENST00000552433	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433		H0Y9J4	135 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	GABARAP	H6UMI1	98 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	CD5L	O43866	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	LYZL6	O75951	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	CCL5	P13501	91 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	GADD45A	P24522	165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	PNOC	Q13519	176 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	CST6	Q15828	149 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433		Q6AWC8	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	OR51H1	Q8NH63	302 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	PKMYT1	Q99640	499 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	AICDA	Q9GZX7	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	CA10	Q9NS85	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433		A0A1B0GUL6	1792 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	LTBP2	Q14767	1821 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	CIT	O14578	2027 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	XKRY	O14609	159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	CTSE	P14091	401 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	OPRM1	P35372	400 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	ATP5G2	Q06055	141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	KLK6	Q92876	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	TSLP	Q969D9	159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	RAB37	Q96AX2	223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	AQP10	Q96PS8	301 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	CDH23	Q9H251	3354 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433		F5H5P2	479 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	NAPSA	O96009	420 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	HERVK_113	P63121	156 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433		Q6ZS92	163 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433		Q6ZUT4	128 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	OR4K13	Q8NH42	304 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	RFESD	Q8TAC1	157 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	LMX1A	Q8TE12	382 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	PEBP4	Q96S96	227 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	NAA60	Q9H7X0	242 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	PCTP	Q9UKL6	214 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-233	ENST00000552433	MYH6	P13533	1939 aa		4.84	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	TMEM131	Q92545	1883 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	COL1A2	P08123	1366 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-233	ENST00000552433	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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