RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 TMEM56Q96MV1 263 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-230ENST00000551968 UHRF2Q96PU4 802 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-230ENST00000551968 METTL26Q96S19 204 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-230ENST00000551968 MND1Q9BWT6 205 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-230ENST00000551968 SLC35B3Q9H1N7 401 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-230ENST00000551968 Q9H3A6 140 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-230ENST00000551968 U3KQE9 123 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-230ENST00000551968 FCER2P06734 321 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 LPAR6P43657 344 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 ERVK-16P61578 105 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 MLANAQ16655 118 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 Q6ZSN1 163 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa9.46□□□□□ -0.9
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CS-230ENST00000551968 F5H768 121 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 ARL6IP5O75915 188 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 SNAPC5O75971 98 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 NPBWR1P48145 328 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 ICAM4Q14773 271 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 FCN2Q15485 313 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 SPINK9Q5DT21 86 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 C16orf54Q6UWD8 224 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 PQLC1Q8N2U9 271 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 UFD1Q92890 307 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 ZNF586Q9NXT0 402 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 PRNDQ9UKY0 176 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 METTL21EPA6NDL7 271 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 HBE1P02100 147 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 RLN1P04808 185 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 DEFB130BP0DP73 79 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 DEFB130AP0DP74 79 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 GNRHRP30968 328 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 LINC00315P59091 139 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 TMEM17Q86X19 198 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 SMIM30A4D0T7 59 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 FAM229AH3BQW9 127 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 EBAG9O00559 213 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 IGKV1-17P01599 117 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 F2RP25116 425 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 RRN3P1Q2M238 152 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 TIGITQ495A1 244 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 KCTD21Q4G0X4 260 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 TTC32Q5I0X7 151 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 TPRA1Q86W33 373 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 S100A14Q9HCY8 104 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 DNAH10OSP0CZ25 163 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 ALDH3B2P48448 385 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 GNG2P59768 71 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 ARPC4P59998 168 aa9.42□□□□□ -0.9
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CS-230ENST00000551968 PRCDQ00LT1 54 aa9.42□□□□□ -0.9
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CS-230ENST00000551968 BEST4Q8NFU0 473 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 LGALS14Q8TCE9 139 aa9.42□□□□□ -0.9
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CS-230ENST00000551968 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 F6UB75 175 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 CLN5O75503 358 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 HSMCR30P0CW71 290 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 CLINT1Q14677 625 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 ARL6IP1Q15041 203 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 OR4B1Q8NGF8 309 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 NRN1Q9NPD7 142 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 FKBP11Q9NYL4 201 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 PTTG2Q9NZH5 202 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 PTGES3LE9PB15 166 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 IGKV1-39P01597 117 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 IGKV1D-39P04432 117 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 ESRGQ1W209 222 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 TMEM69Q5SWH9 247 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 CDPF1Q6NVV7 123 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 DHRSXQ8N5I4 330 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-230ENST00000551968 A0A1W2PPQ1 181 aa9.39□□□□□ -0.91
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CS-230ENST00000551968 ZNF79Q15937 498 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-230ENST00000551968 HOGA1Q86XE5 327 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-230ENST00000551968 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-230ENST00000551968 SYT8Q8NBV8 401 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-230ENST00000551968 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-230ENST00000551968 LINC00052Q96N35 136 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-230ENST00000551968 UPK3BQ9BT76 320 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-230ENST00000551968 LYRM9A8MSI8 78 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-230ENST00000551968 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CS-230ENST00000551968 AZU1P20160 251 aa9.38□□□□□ -0.91
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