RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 HSPA13P48723 471 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 EMP1P54849 157 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 PSMG4Q5JS54 123 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 TBC1D26Q86UD7 250 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 SPARTQ8N0X7 666 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 ZNF114Q8NC26 417 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 XCL2Q9UBD3 114 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 HLA-DMAP28067 261 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 TMEM230Q96A57 120 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 RAB40CQ96S21 281 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 TMEM231Q9H6L2 316 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 A0A0A6YYH2 397 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 A6NJ64 397 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 HRH1P35367 487 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 TGFBR1P36897 503 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 FXYD7P58549 80 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 DHRS2Q13268 280 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 LGALS9BQ3B8N2 356 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 TIGITQ495A1 244 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 TMEM41BQ5BJD5 291 aa11.54□□□□□ -0.56
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CS-227ENST00000551441 DCANP1Q8TF63 244 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 METTL26Q96S19 204 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 LRP1BQ9NZR2 4599 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 A0A1W2PS18 150 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 SNCAP37840 140 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 CADM3Q8N126 398 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 GRAMD2BQ96HH9 432 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-227ENST00000551441 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 IFNA21P01568 189 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 IFNA17P01571 189 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 HTN3P15516 51 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 NPY1RP25929 384 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 CRYBB3P26998 211 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 ETV6P41212 452 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 TAS2R20P59543 309 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 DEFB1P60022 68 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 GABARAPL2P60520 117 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 TSPAN5P62079 268 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 GSG1LQ6UXU4 331 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 LYSMD2Q8IV50 215 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 SLC35G3Q8N808 338 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 ANAPC10Q9UM13 185 aa11.52□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 HELTA6NFD8 242 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 CLN5O75503 358 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 IGKV3-20P01619 116 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 OPRK1P41145 380 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 SCAND1P57086 179 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 TAS2R46P59540 309 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 TMEM69Q5SWH9 247 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 Q6ZRM9 215 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 IGKV1-5P01602 117 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 Q6ZR54 194 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 NACAE9PAV3 2078 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 A0A0B4J293 547 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 NAT1P18440 290 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 PI3P19957 117 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 S100GP29377 79 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 SAMD12Q8N8I0 201 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 IGKV1-17P01599 117 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 CD74P04233 296 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 PRSS3P35030 304 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 UBE2NLQ5JXB2 153 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 C16orf54Q6UWD8 224 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 FCGR1BQ92637 280 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 APOBP04114 4563 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 FAM90A26D6RGX4 464 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 H3BMM0 161 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 M0QYG6 137 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 SPART-AS1P0CW21 52 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 AKR1C2P52895 323 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP11.47□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 NEDD8Q15843 81 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 C1orf134Q5TEV5 83 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 GDF5OSQ5U4N7 250 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 LPCAT3Q6P1A2 487 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 OR4X1Q8NH49 305 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 GLMPQ8WWB7 406 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 VCX3BQ9H321 246 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 U3KQE9 123 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 PGAM2P15259 253 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 SP6Q3SY56 376 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 SOHLH1Q5JUK2 328 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 FAM222AQ5U5X8 452 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 TP53RKQ96S44 253 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 PDCD10Q9BUL8 212 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 ENY2Q9NPA8 101 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
CS-227ENST00000551441 RAB26Q9ULW5 256 aa11.46□□□□□ -0.57
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