RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551295.6

CNTN1-208, Transcript of contactin 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNTN1, Length 5,557 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTN1-208	ENST00000551295	IGFBP2	P18065	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	EGR1	P18146	543 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	DLX1	P56177	255 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	ICAM4	Q14773	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	ATP6V0B	Q99437	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	RP1	P56715	2156 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295		H0Y8G0	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	ELANE	P08246	267 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	HBB	P68871	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	BATF	Q16520	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	PRORY	Q9H606	182 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	SVIL	O95425	2214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295		H3BUX3	64 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	CCL20	P78556	96 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	LINC00477	Q96M19	166 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	IMMP2L	Q96T52	175 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	APC2	O95996	2303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295		A6NJY4	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	COL8A2	P25067	703 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	CRYBB3	P26998	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	POU2AF1	Q16633	256 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	TOMM40	O96008	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	IER3	P46695	156 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	PARL	Q9H300	379 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	ATP5L	O75964	103 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	PLAUR	Q03405	335 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	SFRP2	Q96HF1	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295		Q9H3A6	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295		A0A1B0GUT8	65 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	C10orf142	B7Z368	130 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	GHRH	P01286	108 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	LYNX1	P0DP58	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	FOSL1	P15407	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	NEU1	Q99519	415 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	IL36B	Q9NZH7	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	SMIM6	P0DI80	62 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	SAA4	P35542	130 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	TCL1A	P56279	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	TMEM89	A2RUT3	159 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	REG4	Q9BYZ8	158 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	EPDR1	Q9UM22	224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	ACACA	Q13085	2346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	ZNHIT1	O43257	154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	LYL1	P12980	280 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNTN1-208	ENST00000551295	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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