RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549123.5

TCTN1-222, Transcript of tectonic family member 1, human

TSL 2

Gene TCTN1, Length 458 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCTN1-222	ENST00000549123	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	3.34	□□□□□ -1.87	2e-12	■■■■■ 46.8
TCTN1-222	ENST00000549123	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	MSGN1	A6NI15	193 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123		E7EUB6	86 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123		G3V318	75 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	LYRM1	O43325	122 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	UPK1B	O75841	260 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	NDUFB6	O95139	128 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	BRI3	O95415	125 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	CDS2	O95674	445 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	OR5AC1	P0C628	307 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123		P0C879	139 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	HLA-G	P17693	338 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	PSMB8	P28062	276 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	BTC	P35070	178 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	G6PC	P35575	357 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	RAB9A	P51151	201 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	CCR6	P51684	374 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	ERVK-16	P61578	105 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	GNB1	P62873	340 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	TMEM187	Q14656	261 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	TRIM16L	Q309B1	348 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	SP6	Q3SY56	376 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123		Q75L30	129 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	FAM219A	Q8IW50	185 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	LFNG	Q8NES3	379 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	ARPC1A	Q92747	370 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	IL22RA2	Q969J5	263 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	TMEM56	Q96MV1	263 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	PRND	Q9UKY0	176 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	HERC2	O95714	4834 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123		A0A0B4J2A0	478 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123		A0A1B0GW64	132 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123		A0A1W2PN81	502 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	C15orf61	A6NNL5	157 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123		H3BUA1	57 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	SOX15	O60248	233 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	CIDEA	O60543	219 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	SNAPC5	O75971	98 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	IGKV1-5	P01602	117 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	CRYGC	P07315	174 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	OR9G9	P0C7N8	305 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	ANXA3	P12429	323 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	AKR1C4	P17516	323 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	SLC6A1	P30531	599 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	CHRNA7	P36544	502 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	OR2B8P	P59922	312 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	IFITM3	Q01628	133 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	ASAH1	Q13510	395 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	ECSCR	Q19T08	205 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	KLK9	Q2XQG4	91 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	ZNF429	Q86V71	674 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	ZNF695	Q8IW36	515 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	LGI3	Q8N145	548 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	LRTM2	Q8N967	370 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	OR5T1	Q8NG75	326 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCTN1-222	ENST00000549123	OR5B3	Q8NH48	314 aa		3.32	□□□□□ -1.88

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