RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 OR4C46A6NHA9 309 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 K7EMT4 169 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 SLC31A2O15432 143 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 SOCS1O15524 211 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 SNAPC5O75971 98 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 TNFAIP8O95379 198 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 CRYZL1O95825 349 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV3-7P01780 117 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 IGKV1-16P04430 117 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 GNAO1P09471 354 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 PAX6P26367 422 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 FABP5Q01469 135 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM187Q14656 261 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 GNMTQ14749 295 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 OPCMLQ14982 345 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 TNXAQ16473 311 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF674Q2M3X9 581 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF876PQ49A33 203 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 RPL39P5Q59GN2 51 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 GPR141Q7Z602 305 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 ZFP41Q8N8Y5 198 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 BEST4Q8NFU0 473 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 OR5AP2Q8NGF4 316 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 OR13C5Q8NGS8 318 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 GATAD1Q8WUU5 269 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 GIMAP1Q8WWP7 306 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 C2orf48Q96LS8 159 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 ATG5Q9H1Y0 275 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 SRD5A3Q9H8P0 318 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 IFT46Q9NQC8 304 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 SDHAF2Q9NX18 166 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 RHBDL2Q9NX52 303 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 CACNG5Q9UF02 275 aa3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 A0A087WW49 117 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 A0A087WXM4 84 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 G3V318 75 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 NDUFA4O00483 81 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 SOX15O60248 233 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 FABP1P07148 127 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 CRYGBP07316 175 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 SCTP09683 121 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF735P0CB33 412 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 SPNP16150 400 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 HLA-GP17693 338 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 PSMB9P28065 219 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 AQP4P55087 323 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM50BP56557 158 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 RHOGP84095 191 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 DEFB136Q30KP8 78 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 C15orf32Q32M92 178 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 CDNFQ49AH0 187 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 UBE2NLQ5JXB2 153 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 CASC10Q5T4H9 136 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 SFXN4Q6P4A7 337 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF773Q6PK81 442 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 IZUMO2Q6UXV1 221 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM91Q6ZNR0 172 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 HOGA1Q86XE5 327 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 ARRDC1Q8N5I2 433 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 GDPD1Q8N9F7 314 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 OR1L8Q8NGR8 309 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 OR13F1Q8NGS4 319 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 OR6F1Q8NGZ6 308 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM203Q969S6 136 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 SCGB3A2Q96PL1 93 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 BCL7BQ9BQE9 202 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 PDCD10Q9BUL8 212 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 GNB4Q9HAV0 340 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 TAS2R8Q9NYW2 309 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 OR1A1Q9P1Q5 309 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 LINC00527Q9UJ94 153 aa3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 TRAV39A0A0B4J263 110 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 INS-IGF2F8WCM5 200 aa3.14□□□□□ -1.91
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