RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517072.1

RNU6-334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-334P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-334P-201ENST00000517072 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 MICAL3Q7RTP6 2002 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 COL4A5P29400 1685 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 C2orf70A6NJV1 201 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 C19orf84I3L1E1 186 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR2T1O43869 369 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 TTRP02766 147 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 OMPP47874 163 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 RPS20P60866 119 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 RAB4BP61018 213 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 OOSP2Q86WS3 158 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 KLK9Q9UKQ9 250 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 CLDN24A6NM45 220 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 CDC42P60953 191 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 CLDN22Q8N7P3 220 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 ADCY9O60503 1353 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 EXPH5Q8NEV8 1989 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 PIRO00625 290 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 UBL3O95164 117 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 RBP1P09455 135 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 RHOGP84095 191 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 C8orf76Q96K31 380 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 TMEM147Q9BVK8 224 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 PARVGQ9HBI0 331 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 S100A4P26447 101 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 CEBPGP53567 150 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 BORCS7Q96B45 105 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 CCDC42Q96M95 316 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 CCDC90BQ9GZT6 254 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 DCSTAMPQ9H295 470 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR2J2O76002 312 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR6V1Q8N148 313 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 KRT222Q8N1A0 295 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 OSTCQ9NRP0 149 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 NEO1Q92859 1461 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 DOCK5Q9H7D0 1870 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 M0R2N4 97 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 PROSCO94903 275 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 SSR2P43308 183 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP1.06□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 Q8N814 137 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 SFT2D1Q8WV19 159 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP1.06□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 HS3ST2Q9Y278 367 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 SULT1B1O43704 296 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 RPP14O95059 124 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 LINC01554Q52M75 96 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR13D1Q8NGV5 346 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 CT55Q8WUE5 264 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 GPR146Q96CH1 333 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 C2orf50Q96LR7 162 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 ACER3Q9NUN7 267 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 EPDR1Q9UM22 224 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 CYSLTR1Q9Y271 337 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZFP30Q9Y2G7 519 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 NOTCH1P46531 2555 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 CNIH1O95406 144 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 MGST1P10620 155 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 EDDM3AQ14507 147 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR8J2Q8NGG1 315 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR10J5Q8NHC4 309 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 A0A087WUJ7 227 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 C7orf71A4D174 169 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 LYZL6O75951 148 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR4E1P0C645 316 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM236CP0DP71 79 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 CASP1P29466 404 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 DEFA1P59665 94 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 RGS21Q2M5E4 152 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 GDPD1Q8N9F7 314 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 C4orf3Q8WVX3 66 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 RASL12Q9NYN1 266 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 ROBO3Q96MS0 1386 aa1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms