RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 HACD4Q5VWC8 232 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 LCN12Q6JVE5 192 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 CNIH2Q6PI25 160 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 FAM223AQ8IWN6 122 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 SGPP2Q8IWX5 399 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF645Q8N7E2 425 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 OR5T1Q8NG75 326 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 MUC7Q8TAX7 377 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 CASTOR1Q8WTX7 329 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 CNBD2Q96M20 576 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 PHB2Q99623 299 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 TM2D3Q9BRN9 247 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 ATG5Q9H1Y0 275 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 THYN1Q9P016 225 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 ETV7Q9Y603 341 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 A0A0A6YYH2 397 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 A6NJ64 397 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 TRIM64CA6NLI5 447 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 CRYZL1O95825 349 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 MAS1LP35410 378 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 TNXAQ16473 311 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 RPEL1Q2QD12 228 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 KLK9Q2XQG4 91 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 C22orf42Q6IC83 251 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 IL34Q6ZMJ4 242 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 KCTD9Q7L273 389 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 LAX1Q8IWV1 398 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 Q8N402 240 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 TTC9CQ8N5M4 171 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 NECAP1Q8NC96 275 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 OR4S2Q8NH73 311 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 C5orf30Q96GV9 206 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 OR51E2Q9H255 320 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 Q9H521 79 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 PLEKHA3Q9HB20 300 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 COA4Q9NYJ1 87 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 ANXA10Q9UJ72 324 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 KLK9Q9UKQ9 250 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 SSR3Q9UNL2 185 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 RYR3Q15413 4870 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 A0A075B6Q4 140 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF320A2RRD8 509 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 CCSO14618 274 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 DHFRP00374 187 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 HRASP01112 189 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 PSMB9P28065 219 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 KIR2DS2P43631 304 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 SYNJ2BPP57105 145 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 GNG2P59768 71 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 RHOGP84095 191 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 ATP5G2Q06055 141 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 CASC10Q5T4H9 136 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 SFXN4Q6P4A7 337 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 OR4A5Q8NH83 315 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 ACOT12Q8WYK0 555 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 MAFIPQ8WZ33 124 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 BORCS5Q969J3 196 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 OR2A7Q96R45 310 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM235A6NFC5 223 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 LGALS9O00182 355 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 GGCTO75223 188 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 KBTBD11O94819 623 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 CRYGCP07315 174 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF735P0CB33 412 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 FOLR2P14207 255 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 CBX5P45973 191 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 FHITP49789 147 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 ARPC4P59998 168 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 RPL30P62888 115 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 MUC21Q5SSG8 566 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF773Q6PK81 442 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 IDO2Q6ZQW0 420 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 TMUB2Q71RG4 321 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 GPHB5Q86YW7 130 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 BEST4Q8NFU0 473 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 CD300LFQ8TDQ1 290 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 ISOC1Q96CN7 298 aa4.47□□□□□ -1.69
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