RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	VCX3B	Q9H321	246 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	THYN1	Q9P016	225 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A075B6Q4	140 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A0A6YYH2	397 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A1B0GW64	132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552		A6NJ64	397 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	HLA-G	P17693	338 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61	1e-6	■■■■□ 20.2
PDE4D-222	ENST00000514552	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	BMI1	P35226	326 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	APOC4	P55056	127 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	AQP4	P55087	323 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	OR10A3	P58181	314 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	TAS2R31	P59538	309 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	ARPC4	P59998	168 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	GABARAPL2	P60520	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	CDNF	Q49AH0	187 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	TPRA1	Q86W33	373 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	BORCS5	Q969J3	196 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	COMMD9	Q9P000	198 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	MLX	Q9UH92	298 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	DEFA4	P12838	97 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	AREG	P15514	252 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	NQO2	P16083	231 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	GNG2	P59768	71 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	OR2B8P	P59922	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	CATR1	Q13166	79 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	BTNL8	Q6UX41	500 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	FCGR1B	Q92637	280 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552		Q9H8V8	135 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF320	A2RRD8	509 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM235	A6NFC5	223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	OR4C46	A6NHA9	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552		E7EUB6	86 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	NDUFA4	O00483	81 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	SSX5	O60225	188 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	HPRT1	P00492	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	PPY	P01298	95 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	C22orf42	Q6IC83	251 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	SPATA2	Q9UM82	520 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE4D-222	ENST00000514552	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61

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