RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 C15orf62A8K5M9 175 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 OR11H12B2RN74 326 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 RELQ04864 619 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 LGI3Q8N145 548 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 OR52B4Q8NGK2 314 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 OR10C1Q96KK4 312 aa13.99□□□□□ -0.17
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SH3BP2-218ENST00000511185 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1B0GU03 582 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 CORTO00230 105 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 YIF1AO95070 293 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 ANXA3P12429 323 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 TNFRSF9Q07011 255 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SMCO1Q147U7 214 aa13.98□□□□□ -0.17
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SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM128Q5BJH2 165 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 DUSP18Q8NEJ0 188 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 DEDD2Q8WXF8 326 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 HSPB7Q9UBY9 170 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 FLVCR2Q9UPI3 526 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 K7EMT4 169 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SFT2D2O95562 160 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 IL7P13232 177 aa13.97□□□□□ -0.17
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SH3BP2-218ENST00000511185 C2orf83Q53S99 150 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 TOMM20LQ6UXN7 152 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 CENPSQ8N2Z9 138 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 CITED4Q96RK1 184 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF2Q99496 336 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 RBKSQ9H477 322 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 UBQLN2Q9UHD9 624 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP13.97□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 CHEK1O14757 476 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM50AO95807 157 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 APOHP02749 345 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 NPY1RP25929 384 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 NPBWR1P48145 328 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 INPP1P49441 399 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC16A13Q7RTY0 426 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM110AQ9BQ89 295 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 ZMAT4Q9H898 229 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SMPXQ9UHP9 88 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAV25A0A0B4J276 109 aa13.95□□□□□ -0.18
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SH3BP2-218ENST00000511185 CLN5O75503 358 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFB6O95139 128 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 ODF3L2Q3SX64 289 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 TIGITQ495A1 244 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF600Q6ZNG1 722 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 LRTM2Q8N967 370 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM116Q8NCL8 245 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4X1Q8NH49 305 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 OR1S1Q8NH92 325 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 DTD1Q8TEA8 209 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 ST8SIA2Q92186 375 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 CSMD3Q7Z407 3707 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 STARD9Q9P2P6 4700 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 PITX3O75364 302 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV1-17P01599 117 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 RND2P52198 227 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 PRSS54Q6PEW0 395 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATA25Q9BR10 227 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFA13Q9P0J0 144 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa13.93□□□□□ -0.18
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SH3BP2-218ENST00000511185 LILRB2Q8N423 598 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 NAP1L6A6NFF2 107 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 HOXB5P09067 269 aa13.92□□□□□ -0.18
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SH3BP2-218ENST00000511185 IAPPP10997 89 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 HIPK2Q9H2X6 1198 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 C9orf170A2RU37 121 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 MPTX1A8MV57 137 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 PLA2G10O15496 165 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAP1O75689 374 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-218ENST00000511185 IFNA10P01566 189 aa13.91□□□□□ -0.18
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SH3BP2-218ENST00000511185 GINS3Q9BRX5 216 aa13.91□□□□□ -0.18
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