RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 DYNAPQ8N1N2 210 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 Q8N6K4 173 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 OR1P1Q8NH06 330 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 OR4F5Q8NH21 305 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 AJUBAQ96IF1 538 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 OR4F4Q96R69 305 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 TBX15Q96SF7 602 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 NAT8Q9UHE5 227 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 FUT9Q9Y231 359 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 POLQO75417 2590 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 C11orf94C9JXX5 98 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 F6UZH7 168 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 CLN5O75503 358 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 FOXH1O75593 365 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2C1O95371 312 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 MOSP00540 346 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 REG1AP05451 166 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 PDLIM4P50479 330 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 GNB1P62873 340 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 FBLN7Q53RD9 439 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 ETFRF1Q6IPR1 90 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 NANPQ8TBE9 248 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 NPIPB3Q92617 1050 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 ISOC2Q96AB3 205 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 MALSU1Q96EH3 234 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF503Q96F45 646 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 BPESC1Q9GZL8 116 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 PARLQ9H300 379 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 DMRT1Q9Y5R6 373 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-209ENST00000504450 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC168Q8NDH2 2452 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 VWC2LB2RUY7 222 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 NBR2O15453 112 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 PDE6DO43924 150 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 ACTL6BO94805 426 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP5G3P48201 142 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 RND2P52198 227 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 LCN2P80188 198 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM78BQ5VT40 261 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM24BQ8N5W8 94 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2T10Q8NGZ9 312 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 ACY3Q96HD9 319 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 SMIM7Q9BQ49 75 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 MED13LQ71F56 2210 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PRD5 423 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PRF3 423 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PRM7 423 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 CORTO00230 105 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 RAB5AP20339 215 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 UBE2E1P51965 193 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 UBE2G2P60604 165 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 SELENOTP62341 195 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 PATE2Q6UY27 113 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 C19orf35Q6ZS72 473 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM116Q8NCL8 245 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 RNF2Q99496 336 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 TRGV9Q99603 122 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 DOK5Q9P104 306 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 HIVEP1P15822 2718 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 I3L2K1 104 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 TSPAN9O75954 239 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 TOX4O94842 621 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 MT-CO2P00403 227 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 C8orf88P0DMB2 117 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 CTRB1P17538 263 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF90Q03938 601 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 ELOBQ15370 118 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 MMDQ15546 238 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 SSX2Q16385 188 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms