RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 YIF1AO95070 293 aa12.7□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 NDUFB6O95139 128 aa12.7□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 SFT2D2O95562 160 aa12.7□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 CD7P09564 240 aa12.7□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 OPRK1P41145 380 aa12.7□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 NPBWR1P48145 328 aa12.7□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 TNFRSF9Q07011 255 aa12.7□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 LRTM2Q8N967 370 aa12.7□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 HSPB7Q9UBY9 170 aa12.7□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 CACFD1Q9UGQ2 172 aa12.7□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 A0A1B0GU03 582 aa12.69□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 C15orf62A8K5M9 175 aa12.69□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 CENPXA8MT69 81 aa12.69□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 C2orf83Q53S99 150 aa12.69□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 OR1S1Q8NH92 325 aa12.69□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 HIPK2Q9H2X6 1198 aa12.69□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 RBKSQ9H477 322 aa12.69□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 TUBA4BQ9H853 241 aa12.69□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 FLVCR2Q9UPI3 526 aa12.69□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 U3KQK5 164 aa12.69□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM50AO95807 157 aa12.68□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 BTCP35070 178 aa12.68□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC24A4Q8NFF2 622 aa12.68□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 DTD1Q8TEA8 209 aa12.68□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM170AQ8WVE7 144 aa12.68□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 TRAV25A0A0B4J276 109 aa12.67□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 A6NHS1 94 aa12.67□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 DEFB125Q8N687 156 aa12.67□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 OR4X1Q8NH49 305 aa12.67□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 OR10C1Q96KK4 312 aa12.67□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 WFDC10AQ9H1F0 79 aa12.67□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 SMPXQ9UHP9 88 aa12.67□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 TENM3Q9P273 2699 aa12.66□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa12.66□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 C9orf170A2RU37 121 aa12.66□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 OR11H12B2RN74 326 aa12.66□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 PLA2G10O15496 165 aa12.66□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 PITX3O75364 302 aa12.66□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 CLN5O75503 358 aa12.66□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 IFNA10P01566 189 aa12.66□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 HOXB5P09067 269 aa12.66□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 NPY1RP25929 384 aa12.66□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 CNPY1Q3B7I2 92 aa12.66□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 TOMM20LQ6UXN7 152 aa12.66□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF600Q6ZNG1 722 aa12.66□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 OR52B4Q8NGK2 314 aa12.66□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 TMED3Q9Y3Q3 217 aa12.66□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 STAB2Q8WWQ8 2551 aa12.66□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa12.65□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa12.65□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa12.65□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC25A6P12236 298 aa12.65□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa12.65□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 PRSS54Q6PEW0 395 aa12.65□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC16A13Q7RTY0 426 aa12.65□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 NOXA1Q86UR1 476 aa12.65□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM116Q8NCL8 245 aa12.65□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP12.65□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 U3KQ87 197 aa12.65□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa12.65□□□□□ -0.38
KCNQ1-205ENST00000496887 CHEK1O14757 476 aa12.64□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 TSPAN4O14817 238 aa12.64□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 OR4E1P0C645 316 aa12.64□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 DHRS2Q13268 280 aa12.64□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 GGNBP1Q5YKI7 109 aa12.64□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 LINC00299Q6ZSB3 139 aa12.64□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa12.64□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 RCHY1Q96PM5 261 aa12.64□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 RNF2Q99496 336 aa12.64□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 TM2D3Q9BRN9 247 aa12.64□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 GINS3Q9BRX5 216 aa12.64□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa12.64□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 ZMAT4Q9H898 229 aa12.64□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 ZFAND3Q9H8U3 227 aa12.64□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa12.63□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 LYRM1O43325 122 aa12.63□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 IGKV1-17P01599 117 aa12.63□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC25A4P12235 298 aa12.63□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 RND2P52198 227 aa12.63□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 HAGHQ16775 308 aa12.63□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 TIGITQ495A1 244 aa12.63□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 C4orf46Q504U0 113 aa12.63□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 LYG2Q86SG7 212 aa12.63□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 CCDC32Q9BV29 185 aa12.63□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 SRD5A3Q9H8P0 318 aa12.63□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa12.62□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa12.62□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM90A26D6RGX4 464 aa12.62□□□□□ -0.39
KCNQ1-205ENST00000496887 SCGB2A1O75556 95 aa12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms