RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 TUBA4BQ9H853 241 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 MLXQ9UH92 298 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 SELENOKQ9Y6D0 94 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 K7EMT4 169 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 CD81P60033 236 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 TNFRSF9Q07011 255 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 BSXQ3C1V8 233 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKRD55Q3KP44 614 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 C2orf83Q53S99 150 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 C15orf62A8K5M9 175 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM50AO95807 157 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 IFNA10P01566 189 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 MLANAQ16655 118 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 C11orf87Q6NUJ2 197 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 LINC00299Q6ZSB3 139 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM61Q8N0U2 210 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 DTD1Q8TEA8 209 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 NEURL2Q9BR09 285 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 RBKSQ9H477 322 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 HSPB7Q9UBY9 170 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 FLVCR2Q9UPI3 526 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 TMED3Q9Y3Q3 217 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 U3KQ87 197 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 TRAV25A0A0B4J276 109 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 HOXB5P09067 269 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 NPY1RP25929 384 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 ETFRF1Q6IPR1 90 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 S100ZQ8WXG8 99 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-209ENST00000484097 C9orf170A2RU37 121 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 A8MZ25 164 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 LYRM1O43325 122 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 CLN5O75503 358 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC25A6P12236 298 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF600Q6ZNG1 722 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC16A13Q7RTY0 426 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 SBSPONQ8IVN8 264 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 OR4X1Q8NH49 305 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 COQ8AQ8NI60 647 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 GINS3Q9BRX5 216 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC32Q9BV29 185 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 MED6O75586 246 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 CD7P09564 240 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 OR4E1P0C645 316 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC25A4P12235 298 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 C4orf46Q504U0 113 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 OR52B4Q8NGK2 314 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 C19orf73Q9NVV2 129 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 U3KQK5 164 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 PLA2G10O15496 165 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 PITX3O75364 302 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 BTCP35070 178 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 GGNBP1Q5YKI7 109 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 LYG2Q86SG7 212 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM116Q8NCL8 245 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 OR10C1Q96KK4 312 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 ZMAT4Q9H898 229 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 PTTG2Q9NZH5 202 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 SMPXQ9UHP9 88 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 OR11H12B2RN74 326 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM90A26D6RGX4 464 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 IFNA21P01568 189 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 IFNA4P05014 189 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 BMI1P35226 326 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 DHRS2Q13268 280 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 TOMM20LQ6UXN7 152 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 RND2P52198 227 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 CHEK1O14757 476 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 TSPAN4O14817 238 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 IAPPP10997 89 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 RAB11AP62491 216 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 RPP30P78346 268 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 PRSS54Q6PEW0 395 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 DEFB125Q8N687 156 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 OR1S2Q8NGQ3 325 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM170AQ8WVE7 144 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF414Q96IQ9 312 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 C20orf85Q9H1P6 137 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 ADAP1O75689 374 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 TCRBP04435 133 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4-209ENST00000484097 TIGITQ495A1 244 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms