RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 SPRR3Q9UBC9 169 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 SELENOKQ9Y6D0 94 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 OR2T8A6NH00 312 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 OR4C46A6NHA9 309 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 PSG1P11464 419 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 GNG5P63218 68 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 NUDT10Q8NFP7 164 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 OR10W1Q8NGF6 305 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 DDB2Q92466 427 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 NUDT11Q96G61 164 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 JPT1Q9UK76 154 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 RPH3ALQ9UNE2 315 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 PCNX2A6NKB5 2137 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 HIGD1CA8MV81 97 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 J3QR06 171 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 TAX1BP3O14907 124 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 NUDT3O95989 172 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 CD46P15529 392 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 SPRNQ5BIV9 151 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 RNFT1Q5M7Z0 435 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 TRIB1Q96RU8 372 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 VPS25Q9BRG1 176 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 COMMD5Q9GZQ3 224 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 CST9LQ9H4G1 147 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 SAP30LQ9HAJ7 183 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 CT45A1Q5HYN5 189 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 TCF24Q7RTU0 167 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 OR2Z1Q8NG97 314 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 CT45A3Q8NHU0 189 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 MBD6Q96DN6 1003 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP1-206ENST00000469947 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 MUC21A0A140T8X8 626 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 J3QW42 95 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 C8orf88P0DMB2 117 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 MUC21Q5SSG8 566 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF841Q6ZN19 808 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 PMCHL2Q9BQD1 86 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC25A33Q9BSK2 321 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC25A2Q9BXI2 301 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 OR2J3O76001 311 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 IGKV1-16P04430 117 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 TAS2R45P59539 299 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 OCIAD2Q56VL3 154 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 CALYQ9NYX4 217 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 NAV3Q8IVL0 2385 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 C21orf140B9A014 251 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 FNDC10F2Z333 226 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 CRXO43186 299 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 SMIM15Q7Z3B0 74 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF596Q8TC21 504 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM70Q9BUB7 260 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 C1RLQ9NZP8 487 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A1W2PRE2 83 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF137PP52743 207 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF138P52744 262 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM120AOSQ5T036 256 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 CORO2AQ92828 525 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 ST20Q9HBF5 79 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 M0R296 226 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 DEFB125Q8N687 156 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 RND1Q92730 232 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM231DQ6ZW35 169 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 OR2V2Q96R30 315 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 ABI3Q9P2A4 366 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 PEX7O00628 323 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 SNAI2O43623 268 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 CECR9P0C854 216 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 FOXE3Q13461 319 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 GRAMD2BQ96HH9 432 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 H3BTX0 84 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 BLNKQ8WV28 456 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A087X0K7 114 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 C9orf172C9J069 976 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 MGST3O14880 152 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 KIR2DS2P43631 304 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 RTL8BQ17RB0 113 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 SSX8Q7RTT4 187 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF329Q86UD4 541 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP1-206ENST00000469947 ABCA1O95477 2261 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 154.5 ms