RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 OR9G9P0C7N8 305 aa14.94□□□□□ -0.02
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CAPN3-209ENST00000466222 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.94□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 PITPNC1Q9UKF7 332 aa14.94□□□□□ -0.02
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CAPN3-209ENST00000466222 F6UZH7 168 aa14.92□□□□□ -0.02
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CAPN3-209ENST00000466222 OR51G1Q8NGK1 321 aa14.92□□□□□ -0.02
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CAPN3-209ENST00000466222 PAGE4O60829 102 aa14.91□□□□□ -0.02
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CAPN3-209ENST00000466222 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
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CAPN3-209ENST00000466222 CNTFRP26992 372 aa14.9□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 OR10D4PQ8NGN7 298 aa14.9□□□□□ -0.02
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CAPN3-209ENST00000466222 A0A1W2PPV4 95 aa14.9□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 PPP5D1E7EU14 171 aa14.9□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 IFNA10P01566 189 aa14.9□□□□□ -0.02
CAPN3-209ENST00000466222 LURAP1LQ8IV03 231 aa14.9□□□□□ -0.02
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CAPN3-209ENST00000466222 IGHV1-69P01742 117 aa14.88□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 TYMSP04818 313 aa14.88□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 MYOD1P15172 320 aa14.88□□□□□ -0.03
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CAPN3-209ENST00000466222 OR4A47Q6IF82 309 aa14.88□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 GATAD1Q8WUU5 269 aa14.88□□□□□ -0.03
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CAPN3-209ENST00000466222 PDPNQ86YL7 162 aa14.88□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 ACY3Q96HD9 319 aa14.88□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 IMMP2LQ96T52 175 aa14.88□□□□□ -0.03
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CAPN3-209ENST00000466222 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
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CAPN3-209ENST00000466222 TMEM177Q53S58 311 aa14.87□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 FAM120AOSQ5T036 256 aa14.87□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 TREML4Q6UXN2 200 aa14.87□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 OR4C13Q8NGP0 309 aa14.87□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 TPSG1Q9NRR2 321 aa14.87□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 GATCO43716 136 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 CXorf1O96002 111 aa14.86□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 IGLV2-23P01705 113 aa14.86□□□□□ -0.03
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CAPN3-209ENST00000466222 CSPG4Q6UVK1 2322 aa14.86□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.86□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM170AQ8WVE7 144 aa14.86□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 C22orf15Q8WYQ4 148 aa14.86□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 TCF19Q9Y242 345 aa14.86□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 C15orf61A6NNL5 157 aa14.86□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 FNDC10F2Z333 226 aa14.86□□□□□ -0.03
CAPN3-209ENST00000466222 STAG3L2P0CL84 134 aa14.86□□□□□ -0.03
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