RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 ISLRO14498 428 aa14.8□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 IGLV2-23P01705 113 aa14.8□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 IGHV3-48P01763 117 aa14.8□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 LOXP28300 417 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 MC5RP33032 325 aa14.8□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 BAGE3Q86Y29 109 aa14.8□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 BAGE2Q86Y30 109 aa14.8□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa14.8□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.8□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.8□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 CGB1A6NKQ9 187 aa14.8□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
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SYNE4-204ENST00000465425 PAFAH1B2P68402 229 aa14.8□□□□□ -0.04
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SYNE4-204ENST00000465425 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa14.79□□□□□ -0.04
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SYNE4-204ENST00000465425 TMEM155Q4W5P6 130 aa14.78□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa14.78□□□□□ -0.04
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SYNE4-204ENST00000465425 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa14.78□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 TCL1AP56279 114 aa14.78□□□□□ -0.04
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SYNE4-204ENST00000465425 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
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SYNE4-204ENST00000465425 TAS2R60P59551 318 aa14.77□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 SLC35B1P78383 322 aa14.77□□□□□ -0.04
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SYNE4-204ENST00000465425 PCNX1Q96RV3 2341 aa14.77□□□□□ -0.04
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SYNE4-204ENST00000465425 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
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SYNE4-204ENST00000465425 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
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SYNE4-204ENST00000465425 BEND2Q8NDZ0 799 aa14.77□□□□□ -0.05
SYNE4-204ENST00000465425 SAMD10Q9BYL1 202 aa14.77□□□□□ -0.05
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SYNE4-204ENST00000465425 THAP8Q8NA92 274 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNE4-204ENST00000465425 NHLRC2Q8NBF2 726 aa14.76□□□□□ -0.05
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SYNE4-204ENST00000465425 TMEM133Q9H2Q1 129 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNE4-204ENST00000465425 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa14.76□□□□□ -0.05
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SYNE4-204ENST00000465425 Q0VG73 95 aa14.76□□□□□ -0.05
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SYNE4-204ENST00000465425 LINC00305Q7Z4B0 112 aa14.76□□□□□ -0.05
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SYNE4-204ENST00000465425 LINC00479Q96M42 142 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.76□□□□□ -0.05
SYNE4-204ENST00000465425 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa14.75□□□□□ -0.05
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SYNE4-204ENST00000465425 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SYNE4-204ENST00000465425 C22orf15Q8WYQ4 148 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNE4-204ENST00000465425 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SYNE4-204ENST00000465425 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa14.75□□□□□ -0.05
SYNE4-204ENST00000465425 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa14.74□□□□□ -0.05
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SYNE4-204ENST00000465425 AMY1AP04745 511 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNE4-204ENST00000465425 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SYNE4-204ENST00000465425 TNXAQ16473 311 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF600Q6ZNG1 722 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNE4-204ENST00000465425 TBX15Q96SF7 602 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNE4-204ENST00000465425 HSPB9Q9BQS6 159 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNE4-204ENST00000465425 TNFRSF19Q9NS68 423 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNE4-204ENST00000465425 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SYNE4-204ENST00000465425 NAV3Q8IVL0 2385 aa14.74□□□□□ -0.05
SYNE4-204ENST00000465425 PEX7O00628 323 aa14.74□□□□□ -0.05
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