RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 MT-ND4LP03901 98 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 OPN1MWP04001 364 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 OPN1MW2P0DN77 364 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 OPN1MW3P0DN78 364 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 AREGP15514 252 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 PAX1P15863 534 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 COX7A1P24310 79 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 HTR1DP28221 377 aa4.49□□□□□ -1.69
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PTPRC-210ENST00000462363 OR2T6Q8NHC8 308 aa4.49□□□□□ -1.69
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PTPRC-210ENST00000462363 RPS10P5Q9NQ39 176 aa4.49□□□□□ -1.69
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PTPRC-210ENST00000462363 DOK5Q9P104 306 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 ONECUT1Q9UBC0 465 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 FUT9Q9Y231 359 aa4.49□□□□□ -1.69
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PTPRC-210ENST00000462363 SSX2Q16385 188 aa4.48□□□□□ -1.69
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PTPRC-210ENST00000462363 NAT8Q9UHE5 227 aa4.48□□□□□ -1.69
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PTPRC-210ENST00000462363 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRC-210ENST00000462363 F6UZH7 168 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 F8W735 103 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 K7EIM0 57 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 M0R036 132 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 NBR2O15453 112 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 PDE6DO43924 150 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 CLN5O75503 358 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 FOXH1O75593 365 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 OR2C1O95371 312 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-210ENST00000462363 MOSP00540 346 aa4.47□□□□□ -1.69
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