RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.16□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.16□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.16□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.16□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 HERC2O95714 4834 aa6.16□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.15□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.15□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 MPTX1A8MV57 137 aa6.15□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 K7EQG2 157 aa6.15□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGKV1-17P01599 117 aa6.15□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 C4BPBP20851 252 aa6.15□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 ETV6P41212 452 aa6.15□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPP5CP53041 499 aa6.15□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 DEFB131AP59861 70 aa6.15□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 SP6Q3SY56 376 aa6.15□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 LEMD1Q68G75 181 aa6.15□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.15□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.15□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARRDC1Q8N5I2 433 aa6.15□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q8NAQ8 132 aa6.15□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.15□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR11H2Q8NH07 326 aa6.15□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 DCANP1Q8TF63 244 aa6.15□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 RARRES2Q99969 163 aa6.15□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.15□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 GINS3Q9BRX5 216 aa6.15□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 U3KQE9 123 aa6.15□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 PKHD1P08F94 4074 aa6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 DEFB4AO15263 64 aa6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLN5O75503 358 aa6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 PGAM2P15259 253 aa6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRYBB3P26998 211 aa6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 S100GP29377 79 aa6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 NPBWR1P48145 328 aa6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 RORCP51449 518 aa6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 AKR1C2P52895 323 aa6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC35G3Q8N808 338 aa6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 DUSP18Q8NEJ0 188 aa6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 PKD1P98161 4303 aa6.14□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM25AB3EWG3 89 aa6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM25CB3EWG5 89 aa6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM25GB3EWG6 89 aa6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 NXPH3O95157 252 aa6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDS2O95674 445 aa6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR5AC1P0C628 307 aa6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGLC1P0CG04 106 aa6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 TBPP20226 339 aa6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 TIGITQ495A1 244 aa6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM229BQ8NBD8 167 aa6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR4X1Q8NH49 305 aa6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 TERB2Q8NHR7 220 aa6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 GLMPQ8WWB7 406 aa6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 APLNQ9ULZ1 77 aa6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 X6R8D5 127 aa6.13□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 KNCNA6PVL3 124 aa6.12□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 CORTO00230 105 aa6.12□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 CTDSP2O14595 271 aa6.12□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB3DO95716 219 aa6.12□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 IFNA17P01571 189 aa6.12□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD5P06127 495 aa6.12□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 SNCAP37840 140 aa6.12□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 OPRK1P41145 380 aa6.12□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 P2RY1P47900 373 aa6.12□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM187Q14656 261 aa6.12□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.12□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.12□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM230Q96A57 120 aa6.12□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR146Q96CH1 333 aa6.12□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.12□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 COPZ2Q9P299 210 aa6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms