RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAS2R46P59540 309 aa9.59□□□□□ -0.87
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEFB131AP59861 70 aa9.59□□□□□ -0.87
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRCDQ00LT1 54 aa9.59□□□□□ -0.87
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFITM3Q01628 133 aa9.59□□□□□ -0.87
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TOMM20LQ6UXN7 152 aa9.59□□□□□ -0.87
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX29P2Q8IUI4 249 aa9.59□□□□□ -0.87
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM24BQ8N5W8 94 aa9.59□□□□□ -0.87
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5H2Q8NGV7 314 aa9.59□□□□□ -0.87
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DIRAS2Q96HU8 199 aa9.59□□□□□ -0.87
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MIXL1Q9H2W2 232 aa9.59□□□□□ -0.87
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COMMD3Q9UBI1 195 aa9.59□□□□□ -0.87
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa9.58□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAV2A0A0B4J234 112 aa9.58□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FABP12A6NFH5 140 aa9.58□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APOHP02749 345 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHLDA2Q53GA4 152 aa9.58□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LYSMD2Q8IV50 215 aa9.58□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STHQ8IWL8 128 aa9.58□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LILRB2Q8N423 598 aa9.58□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4A16Q8NH70 328 aa9.58□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 V9GYH0 126 aa9.58□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa9.57□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa9.57□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HPGDSO60760 199 aa9.57□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAT1P18440 290 aa9.57□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEFA1P59665 94 aa9.57□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEFA3P59666 94 aa9.57□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OXA1LQ15070 435 aa9.57□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF600Q6ZNG1 722 aa9.57□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa9.57□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR6F1Q8NGZ6 308 aa9.57□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEC22AQ96IW7 307 aa9.57□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.56□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HRH1P35367 487 aa9.56□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPBWR1P48145 328 aa9.56□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAS2R20P59543 309 aa9.56□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL11P62913 178 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERHP84090 104 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM41BQ5BJD5 291 aa9.56□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBE2NLQ5JXB2 153 aa9.56□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM69Q5SWH9 247 aa9.56□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6ZTC4 211 aa9.56□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.56□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D26Q86UD7 250 aa9.56□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUSP18Q8NEJ0 188 aa9.56□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRRQ9GZT4 340 aa9.56□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM231Q9H6L2 316 aa9.56□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RABAC1Q9UI14 185 aa9.56□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PKD1P98161 4303 aa9.55□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAV10A0A0B4J240 114 aa9.55□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM25AB3EWG3 89 aa9.55□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM25CB3EWG5 89 aa9.55□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM25GB3EWG6 89 aa9.55□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PFDN1O60925 122 aa9.55□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV1-39P01597 117 aa9.55□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV1D-39P04432 117 aa9.55□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MIFP14174 115 aa9.55□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HLA-DMBP28068 263 aa9.55□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 S100GP29377 79 aa9.55□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF79Q15937 498 aa9.55□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRGPRFQ96AM1 343 aa9.55□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.54□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GU03 582 aa9.54□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTTG1O95997 202 aa9.54□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPP1P10451 314 aa9.54□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C4BPBP20851 252 aa9.54□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HLA-DMAP28067 261 aa9.54□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PYDC2Q56P42 97 aa9.54□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPINK9Q5DT21 86 aa9.54□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LPCAT3Q6P1A2 487 aa9.54□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGRNO00468 2067 aa9.54□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PS18 150 aa9.53□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 K7EQG2 157 aa9.53□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM50AO95807 157 aa9.53□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APOA1P02647 267 aa9.53□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRSS3P35030 304 aa9.53□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAMD12Q8N8I0 201 aa9.53□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STXBP6Q8NFX7 210 aa9.53□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRAMD2BQ96HH9 432 aa9.53□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOSTQ9BQB4 213 aa9.53□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 X6R8D5 127 aa9.53□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GVY2 172 aa9.53□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL7P13232 177 aa9.53□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELK1P19419 428 aa9.53□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNCAP37840 140 aa9.53□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPAN5P62079 268 aa9.53□□□□□ -0.88
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL18Q14116 193 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms