RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 MCUBQ9NWR8 336 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 I3L2K1 104 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 TSPAN4O14817 238 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.16□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 NMSQ5H8A3 153 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 SCARB1Q8WTV0 552 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 TMEM190Q8WZ59 177 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 HINT2Q9BX68 163 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 UBQLN2Q9UHD9 624 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 FRAS1Q86XX4 4008 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 OR4C46A6NHA9 309 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 A6NHS1 94 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 TGOLN2O43493 480 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 BTCP35070 178 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 ADMP35318 185 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 TMEM128Q5BJH2 165 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 TMEM268Q5VZI3 342 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 SLC25A24Q6NUK1 477 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 SLC35G3Q8N808 338 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 LRTM2Q8N967 370 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 GPR146Q96CH1 333 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 RNF183Q96D59 192 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-204ENST00000403441 A0A0B4J2A0 478 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 NAP1L6A6NFF2 107 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 OR2T8A6NH00 312 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 SPCS3P61009 180 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 SRPXP78539 464 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 SPSB3Q6PJ21 355 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 TXN2Q99757 166 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 C21orf62Q9NYP8 219 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 SHPKQ9UHJ6 478 aa9.14□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 CTSGP08311 255 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 IL7P13232 177 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 AKR1C4P17516 323 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 ERHP84090 104 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 ODF3L2Q3SX64 289 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 CHRDL1Q9BU40 450 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 C20orf24Q9BUV8 137 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 CACNG5Q9UF02 275 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 CACFD1Q9UGQ2 172 aa9.13□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 NDUFA4O00483 81 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 PITX3O75364 302 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 NDUFB6O95139 128 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 MT-CO2P00403 227 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 IFNA17P01571 189 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 SPINK9Q5DT21 86 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 LYZL2Q7Z4W2 148 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 MAP6D1Q9H9H5 199 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 PRR13Q9NZ81 148 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 HSPB7Q9UBY9 170 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 CORTO00230 105 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 DEDDO75618 318 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 SFT2D2O95562 160 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 SULT1A3P0DMM9 295 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 SULT1A4P0DMN0 295 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 SLC25A6P12236 298 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 ANXA3P12429 323 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 CCR6P51684 374 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 PPP1R1AQ13522 171 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 TRIQKQ629K1 86 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 LGI3Q8N145 548 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 CENPSQ8N2Z9 138 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 UBAC2Q8NBM4 344 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 TMEM170AQ8WVE7 144 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 OR10C1Q96KK4 312 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 PDCD10Q9BUL8 212 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 MFFQ9GZY8 342 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 A0A1B0GU03 582 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 K7EMT4 169 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 PLA2G10O15496 165 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 SNCAP37840 140 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 HTR2BP41595 481 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 MFAP4P55083 255 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 SMCO1Q147U7 214 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 CNPY1Q3B7I2 92 aa9.1□□□□□ -0.95
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