RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384069.1

RNU6-811P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 811, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-811P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-811P-201ENST00000384069 IFNB1P01574 187 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 IFNW1P05000 195 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 GP1BAP07359 652 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 MT1BP07438 61 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 MYL2P10916 166 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 COX6B1P14854 86 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 MX1P20591 662 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 GSTM3P21266 225 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 PPIBP23284 216 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 CCND2P30279 289 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 ATP6V0D1P61421 351 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 CBX3Q13185 183 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 SCGB2A2Q13296 93 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 GRK1Q15835 563 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 HSDL1Q3SXM5 330 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 MESTQ5EB52 335 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 CTSL3PQ5NE16 218 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 BRMS1LQ5PSV4 323 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 FAM78BQ5VT40 261 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 C1orf140Q5VVS0 124 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 SYPL2Q5VXT5 272 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 PMF1Q6P1K2 205 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 CSAG1Q6PB30 78 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 C11orf88Q6PI97 169 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 TMEM107Q6UX40 140 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 Q6ZRX8 168 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 CCDC91Q7Z6B0 441 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 Q8IYB0 196 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 TRAM1L1Q8N609 369 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 OR5D14Q8NGL3 314 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 OR8D4Q8NGM9 314 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 OR13D1Q8NGV5 346 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 OR52E5Q8NH55 327 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 OR51Q1Q8NH59 317 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 ITFG1Q8TB96 612 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 SMIM11BQ8TCY0 68 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 FBXO32Q969P5 355 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 GPR146Q96CH1 333 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 CABS1Q96KC9 395 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 YPEL2Q96QA6 119 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 COPS4Q9BT78 406 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 FAM192AQ9GZU8 254 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 RAB1BQ9H0U4 201 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 C2orf40Q9H1Z8 148 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 POPDC3Q9HBV1 291 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 MID1IP1Q9NPA3 183 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 C14orf132Q9NPU4 83 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 DMAC2Q9NW81 257 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 EMC3Q9P0I2 261 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 FBXO5Q9UKT4 447 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 PSME2Q9UL46 239 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 PRELID1Q9Y255 219 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 CFL2Q9Y281 166 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 SNX10Q9Y5X0 201 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 SAR1BQ9Y6B6 198 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 DSPPQ9NZW4 1301 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 TRANK1O15050 2925 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 TNS3Q68CZ2 1445 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 ATMQ13315 3056 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 COL24A1Q17RW2 1714 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 TRAV17A0A0B4J275 112 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 SMCO3A2RU48 225 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 C5orf49A4QMS7 147 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 OR4C45A6NMZ5 311 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 HIGD1CA8MV81 97 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 E7EUB6 86 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-811P-201ENST00000384069 H0Y980 276 aa-0.74□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms