RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 IGHV3-7P01780 117 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 PSMG4Q5JS54 123 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 TSC2P49815 1807 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 A0A1W2PRD5 423 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 A0A1W2PRF3 423 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 A0A1W2PRM7 423 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 A0A1W2PRX2 142 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 PRR19A6NJB7 356 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 CCL21O00585 134 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 JMJD8Q96S16 334 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 CEP350Q5VT06 3117 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 F8WDY8 70 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 PRDX2P32119 198 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 DLX6P56179 175 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 S100A7L2Q5SY68 101 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 MYO7BQ6PIF6 2116 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 MSRB2Q9Y3D2 182 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 M0R3E3 92 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 SYNGR2O43760 224 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 FAM90A2PQ658T7 463 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 NRGNQ92686 78 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 CREBBPQ92793 2442 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 ERVK11-1P61568 191 aa11.52□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 C4orf45Q96LM5 186 aa11.52□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 U3KQE9 123 aa11.52□□□□□ -0.56
CTIF-202ENST00000382998 DSPPQ9NZW4 1301 aa11.52□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 GATA3P23771 443 aa11.52□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 TSKUQ8WUA8 353 aa11.52□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa11.52□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 WDR38Q5JTN6 314 aa11.52□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 FNDC7Q5VTL7 733 aa11.52□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa11.52□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 OR5AS1Q8N127 324 aa11.52□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 P01737 135 aa11.51□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP11.51□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 EDDM3AQ14507 147 aa11.51□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 RND1Q92730 232 aa11.51□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 RTL8AQ9BWD3 113 aa11.51□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 SPANXDQ9BXN6 97 aa11.51□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa11.51□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 KIR2DS2P43631 304 aa11.51□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 FAM166AQ6J272 317 aa11.51□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 CACNG5Q9UF02 275 aa11.51□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 TUSC2O75896 110 aa11.51□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 DPM2O94777 84 aa11.51□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 FOXI1Q12951 378 aa11.51□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 LYZL6O75951 148 aa11.51□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 DLX1P56177 255 aa11.51□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 RPL8P62917 257 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 C1QL3Q5VWW1 255 aa11.51□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 OR9G1Q8NH87 305 aa11.51□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 NUPR1O60356 82 aa11.5□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 PQLC2Q6ZP29 291 aa11.5□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 GTSCR1Q86UQ5 136 aa11.5□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 PILRAQ9UKJ1 303 aa11.5□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 PIN1P1O15428 100 aa11.5□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa11.5□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 SYNGR3O43761 229 aa11.5□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 S100A4P26447 101 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 TMEM211Q6ICI0 200 aa11.5□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 GJC3Q8NFK1 279 aa11.5□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 MYLKQ15746 1914 aa11.5□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 ESPL1Q14674 2120 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 UPK3AO75631 287 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 COL8A1P27658 744 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 MKXQ8IYA7 352 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 OR10AC1Q8NH08 325 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 GGTLC3B5MD39 225 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 J3QLI3 93 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 GRPP07492 148 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 LINC00694P0DN24 101 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 DEFB108BQ8NET1 73 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 FDCSPQ8NFU4 85 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 SPATA25Q9BR10 227 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 ZNF785A8K8V0 405 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 ASIPP42127 132 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 PRSS27Q9BQR3 290 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 AICDAQ9GZX7 198 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 PLCE1Q9P212 2302 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 TMEM229AB2RXF0 380 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 RIGQ13278 110 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 C9orf40Q8IXQ3 194 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 C18orf32Q8TCD1 76 aa11.49□□□□□ -0.57
CTIF-202ENST00000382998 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
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