RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 GABRA6Q16445 453 aa13.74□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 SMIM21Q3B7S5 101 aa13.74□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 ALKBH6Q3KRA9 238 aa13.74□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 OR1B1Q8NGR6 318 aa13.74□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 MBD6Q96DN6 1003 aa13.74□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 COQ2Q96H96 371 aa13.74□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 C1RLQ9NZP8 487 aa13.74□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 ZNF835Q9Y2P0 537 aa13.74□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa13.74□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 NKX2-8O15522 239 aa13.74□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 DUTP33316 252 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 TMEM191AQ9H0A3 160 aa13.74□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 DUSP13Q9UII6 198 aa13.74□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 LAMA5O15230 3695 aa13.74□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 PROP1O75360 226 aa13.74□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 LEPROTL1O95214 131 aa13.74□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 CCL11P51671 97 aa13.74□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 SLC35E4Q6ICL7 350 aa13.74□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 HLA-DRB1P01911 266 aa13.73□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 GRPP07492 148 aa13.73□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 ERVK-16P61578 105 aa13.73□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 TRAT1Q6PIZ9 186 aa13.73□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 Q6ZR03 302 aa13.73□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa13.73□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 FAM231BA6NCW3 169 aa13.73□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 HIGD1CA8MV81 97 aa13.73□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 H0Y8G0 127 aa13.73□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 WNT9BO14905 357 aa13.73□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 CD24P25063 80 aa13.73□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 PAX2Q02962 417 aa13.73□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 FOXE3Q13461 319 aa13.73□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 VWA1Q6PCB0 445 aa13.73□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 CHRDL1Q9BU40 450 aa13.73□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa13.72□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 PPIAL4DF5H284 164 aa13.72□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 GPR183P32249 361 aa13.72□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 OR13A1Q8NGR1 328 aa13.72□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 TMEM140Q9NV12 185 aa13.72□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 G3V4G9 280 aa13.72□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 GPR12P47775 334 aa13.72□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 REG1BP48304 166 aa13.72□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 GRAMD2BQ96HH9 432 aa13.72□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 VWC2LB2RUY7 222 aa13.71□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 TBC1D28Q2M2D7 210 aa13.71□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 PMCHL2Q9BQD1 86 aa13.71□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 UFSP1Q6NVU6 142 aa13.71□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 MOB3BQ86TA1 216 aa13.71□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa13.71□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 TMEM178AQ8NBL3 297 aa13.71□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
GDE1-201ENST00000353258 A0A1W2PRE2 83 aa13.71□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 SNAI2O43623 268 aa13.71□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 IGHV1-2P23083 117 aa13.71□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 ARF6P62330 175 aa13.71□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 SSX8Q7RTT4 187 aa13.71□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 DCTN5Q9BTE1 182 aa13.71□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa13.7□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 FDCSPQ8NFU4 85 aa13.7□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa13.7□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 ZNF826PQ6ZT77 177 aa13.7□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 FAM231DQ6ZW35 169 aa13.7□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 DEFB124Q8NES8 71 aa13.7□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 PTPRBP23467 1997 aa13.7□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 SMPD2O60906 423 aa13.69□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 AGFG2O95081 481 aa13.69□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 RPL39P5Q59GN2 51 aa13.69□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 C2orf91Q6ZV80 131 aa13.69□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 C5orf17Q8NAS9 161 aa13.69□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 OR4S2Q8NH73 311 aa13.69□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 JMJD8Q96S16 334 aa13.69□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 IGHV3-13P01766 116 aa13.69□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 IGHV3-7P01780 117 aa13.69□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 TAS2R45P59539 299 aa13.69□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa13.69□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 HINT2Q9BX68 163 aa13.69□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa13.68□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 A0A1B0GXF2 115 aa13.68□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 GOSR1O95249 250 aa13.68□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 APOA2P02652 100 aa13.68□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 UQCRFS1P47985 274 aa13.68□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 FAM162BQ5T6X4 162 aa13.68□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa13.68□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 WT1P19544 449 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 HTR1DP28221 377 aa13.68□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 OR1N2Q8NGR9 330 aa13.68□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 SVIPQ8NHG7 77 aa13.68□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 METRNQ9UJH8 293 aa13.68□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 FZR1Q9UM11 496 aa13.68□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 CADP27708 2225 aa13.68□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 ICE1Q9Y2F5 2266 aa13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.5 ms